蛋白质组学与生物信息学杂志
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通过细胞表面糖蛋白捕获鉴定胰腺癌中 CD109 过度表达

兰迪·S·豪恩、范春阳、塞缪尔·G·麦金托什、赵宏和艾伦·J·塔克特

背景：新型靶向癌症疗法和/或诊断工具的开发取决于对正常组织和肿瘤之间分子靶标差异表达的理解。许多这些潜在的靶标都是细胞表面受体。然而，我们对胰腺肿瘤中细胞表面蛋白上调的了解有限，从而阻碍了胰腺癌靶向治疗的开发。为了开发专门针对胰腺肿瘤的新诊断和治疗工具，我们试图鉴定可作为潜在肿瘤特异性靶点的细胞表面蛋白。

方法：用双功能接头生物胞素酰肼标记胰腺癌细胞系 BxPC-3 上的膜糖蛋白。蛋白水解消化后，生物素化糖肽被链霉亲和素偶联珠捕获，然后通过 PNGaseF 介导的糖苷内切酶裂解释放，并通过液相色谱-串联质谱 (MS) 进行鉴定。通过胰腺癌细胞系裂解物的蛋白质印迹分析以及通过胰腺导管腺癌和非肿瘤性胰腺组织切片的免疫组织化学来评估通过细胞表面糖蛋白捕获程序鉴定的蛋白质CD109。

结果：从 BxPC-3 细胞捕获的糖肽的 MS/MS 分析揭示了 18 种预测或已知与质膜相关的蛋白质，包括 CD109，而在胰腺癌中尚未有报道。对胰腺癌细胞系裂解物中 CD109 的蛋白质分析显示，CD109 在 8 个细胞系中的 6 个中表达，其中在 BxPC-3、MIAPaCa-2 和 Panc-1 细胞中表达水平较高。人类胰腺组织的免疫组织化学分析表明，与正常胰腺相比，CD109 在胰腺肿瘤中显着过度表达。

结论：从胰腺癌细胞系表面选择性捕获糖肽可以揭示胰腺导管腺癌中表达的新型细胞表面糖蛋白。