真菌基因组学与生物学
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抽象的

麦麸上生长的木霉细胞壁降解酶

莱塞·贝奇、彼得·坎普·巴斯克和琳·兰格

曲霉菌是一种丝状真菌，能够产生和分泌多种用于植物细胞壁降解的胞外水解酶。木霉属因其产生的细胞壁降解酶和强大的分泌能力而受到生物炼制行业的广泛关注。在这里，我们报告了对 T. asperellum 植物细胞壁降解酶的广泛转录组分析。在各种条件下对一系列纤维素材料测试了曲霉 T. asperellum 产生的细胞壁降解酶。当 T. asperellum 在麦麸上生长时，检测到最大范围的酶活性，并且在转录组中鉴定出来自 48 个糖苷水解酶家族的总共 175 个糖苷水解酶。使用生物信息学工具肽模式识别在功能水平上鉴定糖苷水解酶，从而实现有效的酶发现。此外，这还用于重新注释存在于五种公开可用的木霉属物种中的 CAZymes，从而阐明 CAZymes 在功能水平上与糖苷水解酶家族水平相反的差异。这一比较支持这样的理论：糖苷水解酶是从共同祖先进化而来，随后进行了专门化，其中里氏木霉和长臂木霉等腐生真菌丢失了大量基因，包括几种糖苷水解酶。此外，这还用于重新注释存在于五种公开可用的木霉属物种中的 CAZymes，从而阐明 CAZymes 在功能水平上与糖苷水解酶家族水平相反的差异。这一比较支持这样的理论：糖苷水解酶是从共同祖先进化而来，随后进行了专门化，其中里氏木霉和长臂木霉等腐生真菌丢失了大量基因，包括几种糖苷水解酶。此外，这还用于重新注释存在于五种公开可用的木霉属物种中的 CAZymes，从而阐明 CAZymes 在功能水平上与糖苷水解酶家族水平相反的差异。这一比较支持这样的理论：糖苷水解酶是从共同祖先进化而来，随后进行了专门化，其中里氏木霉和长臂木霉等腐生真菌丢失了大量基因，包括几种糖苷水解酶。