蛋白质组学与生物信息学杂志

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国际标准期刊号: 0974-276X

抽象的

流浪蜘蛛 Ctenus hibernalis(蜘蛛:Ctenidae)毒液蛋白质组的表征

杰弗里·科尔、帕特里克·A·布斯卡、詹姆斯·A·莫布里和罗伯特·A·海塔威

蜘蛛毒液是一种富含神经毒性多肽的多组分混合物。目前分类的蜘蛛中一小部分的毒液已被分类。为了确定我们的物种(流浪蜘蛛 Ctenus hibernalis)中表达的毒液蛋白,我们使用 GeLC 方法从粗毒液提取物中构建了一个全面的蛋白质组,该方法需要一维变性凝胶电泳分离并结合整个蛋白质的酶消化泳道切成许多分子量级分,然后进行 LC-ESI-MS2。通过这种方式,我们鉴定了 1,182 个蛋白质,其置信度 >99%,这些蛋白质与来自几种相似蜘蛛物种的组合基因组的序列密切匹配。我们的结果表明,C. hibernalis 含有多种具有与其他物种相似的保守序列的蛋白质。展望未来,下一代测序(NSG)结合扩展注释将用于构建更完整的基因蛋白质组数据库。因此,预计通过这样的进一步研究,人们将对来自昆虫、植物和动物的许多物种的毒液的基因蛋白质组组成有持续不断的了解。我们相信,总的来说,这些方法将有助于更好地理解所有类型毒液背后的生物学,以及治疗暴露患者的方法,同时扩展和利用毒液的各种积极方面。结合扩展注释将用于构建更完整的基因蛋白质组数据库。因此,预计通过这样的进一步研究,人们将对来自昆虫、植物和动物的许多物种的毒液的基因蛋白质组组成有持续不断的了解。我们相信,总的来说,这些方法将有助于更好地理解所有类型毒液背后的生物学,以及治疗暴露患者的方法,同时扩展和利用毒液的各种积极方面。结合扩展注释将用于构建更完整的基因蛋白质组数据库。因此,预计通过这样的进一步研究,人们将对来自昆虫、植物和动物的许多物种的毒液的基因蛋白质组组成有持续不断的了解。我们相信,总的来说,这些方法将有助于更好地理解所有类型毒液背后的生物学,以及治疗暴露患者的方法,同时扩展和利用毒液的各种积极方面。

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