ColonyCountJ：用户友好的 Image J 附加程序，用于在克隆形成分析中量化不同集落参数

抽象的

达摩德拉·库马尔·莫里亚

目的：有几种商业自动菌落计数器可用，但它们相对昂贵并且与一些定量相关的问题相关。自动菌落计数的一些关键问题是菌落聚集和边缘效应。因此，本研究的主要目的是开发一个用户友好的程序，用于确定克隆形成测定的集落参数。

方法：在本研究中，采用分水岭算法与其他 ImageJ 工具一起开发基于 ImageJ 的附加程序（即 ColonyCountJ）来计算各种菌落参数。为了测试这个程序，我们使用了 MCF-7 细胞暴露于不同剂量的 γ 辐射后获得的集落。

结果：使用该程序获得的结果与手动计数以及 Oxford Optronix GelCount 菌落计数器提供的自动计数进行比较。结果发现，我们的结果与手册以及商业程序很好地吻合。总体而言，ColonyCountJ 在处理时间和灵敏度方面的性能与商业菌落计数器相当。

结论：总而言之，为 ImageJ 定制的具有优化参数的“ColonyCountJ”附加程序是对克隆形成实验中获得的菌落进行定量的可靠方法。该计划对于毒理学、辐射生物学和癌症生物学领域的研究人员来说非常有用。