生物医学数据挖掘国际期刊

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国际标准期刊号: 2090-4924

抽象的

基于血浆氨基酸的风险诊断服务的商业化

木村武和今泉晃

抽象的

根据观察结果表明,氨基酸是检查与不同生理状态相关的消化变化的有利代谢组学子集,我们建立了一个创新包(“AminoIndex 创新”),利用血浆氨基腐蚀焦点信息来生产生物标志物,并推广了一种辅助方法依赖于这种创新。为了实现商业化,必须解决来自测试处理、通量、标准化和后续管理的不同问题,并且这些问题中的一部分可能与其他生物标志物商业化相关,将在引言中得到解决。到目前为止,“AminoIndex创新”已被用于生产胃、肺、结直肠、前列腺和胸部恶性肿瘤的机会生物标志物,尤其是最近对于胰腺疾病的检测,自 2011 年 4 月在日本作为生物标志物管理使用以来,它已被 1000 多家急诊诊所和中心接受,作为一种酌情血液检测,并促使收到不同的结果。在日本获得的荣誉。探索正在取得进展,包括其他恶性肿瘤危险生物标志物,就像不同疾病危险的生物标志物一样,并且持续的证据表明,有可能创建生物标志物来预测四年后出现各种感染的风险。我们承认,很快,其他批准的代谢物和组学信息可能会被添加到当前的科学阶段,从而扩大歧视力。尽管存在各种问题,一切都需要完善,我们相信“AminoIndex创新”阶段可以在定制营养和药物领域发挥作用。最近,血浆游离氨基酸 (PFAA) 谱与生活方式相关感染之间的关系已得到解释。尽管如此,几乎没有对大量亚洲人群进行任何关于 PFAA 在评估疾病风险方面的便利性的研究。我们检查了 PFAA 概况评估迄今为止最大的亚洲人口中生活方式相关疾病的能力。

介绍

在这19种氨基酸中,展链氨基酸和芳香氨基酸表明与肥胖和脂质因素有关。与本能脂肪坚固性相关的 PFAA 文件表明,与任何 PFAA 相比,其与因素的相关性较高。在评估与生活方式相关的疾病风险时,根据预期的修正结果,PFAA 文件中与本能脂肪肥胖或胰岛素抵抗相关疾病的风险比例明显高于个体氨基酸水平的大部分风险。令人费解的变量。清单和 PFAA 与每种生活方式相关疾病的隶属关系示例是明确无误的。

代谢组学和框架科学的最新进展使不同氨基酸的高通量估计以及随后针对不同用途的信息挖掘成为可能。最近的研究表明,通过精心计算创建指示性记录,可以利用等离子体氨基腐蚀研究作为生物标志物显示工具的更多机会。此类检查表明,可以创建基于氨基腐蚀的丙型肝炎患者肝纤维化临床指征清单。

方法

禁食 8 小时后对受试者进行血液检查。通过酶法测定绝对胆固醇 (T-CHO)、高密度脂蛋白胆固醇 (HDL-C)、低密度脂蛋白胆固醇 (LDL-C) 和甘油三酯 (TG) 的血清水平。使用己糖激酶技术估算游离血浆葡萄糖 (FPG),并使用乳胶凝集免疫测定法测定 HbA1c。根据最近在其他地方描述的惯例,对等离子体氨基腐蚀焦点进行了研究。暂时禁食后,迅速从下臂静脉收集血液测试(5 mL),并将其放入含有乙二胺四乙酸二钠的试管中,并将试管立即置于冰上。通过在 4°C 下以 3000 rpm 离心 15 分钟来设置血浆,然后存放在 -80°C 直至进行研究。等离子体氨基腐蚀焦点是通过高级流体色谱-电喷雾电离质谱法以及最近描述的柱前衍生化来估计的。估计了伴随的 19 种氨基酸:丙氨酸 (Ala)、精氨酸 (Arg)、天冬酰胺 (Asn)、瓜氨酸 (Cit)、谷氨酰胺 (Gln)、甘氨酸 (Gly)、组氨酸 (His)、异亮氨酸 (Ile)、亮氨酸 ( Leu)、赖氨酸 (Lys)、蛋氨酸 (Met)、鸟氨酸 (Orn)、苯丙氨酸 (Phe)、脯氨酸 (Pro)、丝氨酸 (Ser)、苏氨酸 (Thr)、色氨酸 (Trp)、酪氨酸 (Tyr) 和缬氨酸(瓦尔)。我们没有对其他遗传编码的氨基酸(如谷氨酸、天冬氨酸和半胱氨酸)进行估计,因为它们在血液中的脆弱性。异亮氨酸 (Ile)、亮氨酸 (Leu)、赖氨酸 (Lys)、蛋氨酸 (Met)、鸟氨酸 (Orn)、苯丙氨酸 (Phe)、脯氨酸 (Pro)、丝氨酸 (Ser)、苏氨酸 (Thr)、色氨酸 (Trp)、酪氨酸 (Tyr) 和缬氨酸 (Val)。我们没有对其他遗传编码的氨基酸(如谷氨酸、天冬氨酸和半胱氨酸)进行估计,因为它们在血液中的脆弱性。异亮氨酸 (Ile)、亮氨酸 (Leu)、赖氨酸 (Lys)、蛋氨酸 (Met)、鸟氨酸 (Orn)、苯丙氨酸 (Phe)、脯氨酸 (Pro)、丝氨酸 (Ser)、苏氨酸 (Thr)、色氨酸 (Trp)、酪氨酸 (Tyr) 和缬氨酸 (Val)。我们没有对其他遗传编码的氨基酸(如谷氨酸、天冬氨酸和半胱氨酸)进行估计,因为它们在血液中的脆弱性。

 临床评估

在这项研究中,代谢紊乱的特征是伴随的日本分析模型:本能粗壮(男性腰围 ≥ 85 厘米,女性腰围 ≥ 90 厘米),此外还伴随着三个部分中的任意两个:HDL-C < 40 mg/dL,TG ≥ 150 mg/dL,或使用血脂异常药物;FPG ≥ 110 mg/dL 或正在服用治疗糖尿病的药物;循环压力≥130/85 mmHg或使用降压药。糖尿病的特征是 FPG ≥126 mg/dL、HbA1c ≥ 6.5% 或正在服用糖尿病药物的患者。血脂异常的特征是空腹 LDL-C ≥ 140 mg/dL、HDL-C < 40 mg/dL、TG ≥ 150 mg/dL 或正在服用血脂异常处方的个体。

PFAA指数的计算

在本研究中,我们利用了过去报告中开发和批准的氨基腐蚀剂清单 1 和文件 2。氨基腐蚀记录 1 是具有多种选择的直接复发模型,以显示 PFAA 谱与本能脂肪区域之间的联系,包括 Leu、Ala、Tyr、Asn、Trp 和 Gly。氨基腐蚀列表 2 是多种直接复发模型,具有多种选择,可显示 PFAA 谱与攻击后 2 小时胰岛素水平(Ins120 分钟)之间的关系,包括 Ile、Ala、Tyr、Phe、Met 和 His 。因此,这些 PFAA 列表中的每一个都是一项单独的测量,其中包含多维 PFAA 概况的数据。PFAA 概况数据的这种压力使得患者和对照受试者之间的分离更加明显。

 PFAA 与代谢变量之间的相关性

利用 Pearson 项目二级关系系数,如最近描述的那样,对每一项 PFAA 固定和 PFAA 记录与代谢因素之间的联系进行了研究。此外,还进行了依赖于PFAA焦点与额外估计因素之间的关系系数网络的二维多层次群调查。对于每个单独的 PFAA 和 PFAA 文件,使用了三个独特的模型,无论是否对以下因素进行了更改:模型 1) 未更改,模型 2) 平衡年龄和性取向,模型 3) 平衡年龄、性别和体重文件(BMI)。

PFAA 与生活方式相关疾病的关联

我们分析了 PFAA 谱与生活方式相关疾病的联系,以确定每个 PFAA 文件和单个 PFAA 病灶是否与糖尿病、代谢状况、血脂异常和高血压有关。PFA 列表和全部氨基酸按比例调整为 1 SD 的产品。采用策略性复发调查来调查每个 PFAA 记录和单个 PFAA 固定情况作为评估这些疾病的持续因素的作用。计算的复发调查是根据年龄和性取向的变化进行的。此外,为了避免疾病对单个PFAA水平和每个PFAA文件的横向影响,进一步进行了如下修改:年龄、性别和BMI的代谢紊乱;DM 的年龄、性取向、BMI、LDL-C、HDL-C、TG、SBP 和 DBP;血脂异常与年龄、性别、BMI、FPG、HbA1c、收缩压和舒张压;高血压的年龄、性别、BMI、FPG、HbA1c、LDL-C、HDL-C 和 TG。

p < 0.01 的双边似然估计被认为实际上值得注意。R 演绎版 3.1.3 [R 核心团队 (2015)。R:事实登记的语言和条件。R 统计计算基金会,维也纳,奥地利]用于可测量的检查。在整个研究过程中,所有信息都被秘密检查。

讨论

目前的研究已证实,分别反映 VFA 和胰岛素抵抗的 PFAA 指数可以评估在最大的日本人口中调查的与生活方式相关的疾病。在本研究中,指数1与大多数变量的相关性比任何单一氨基酸都更显着,且趋势比指数2更明显。指数和PFAA与每种生活方式相关疾病的关联模式是不同的。尽管在排除疾病之间的交叉效应后,高血压与 BCAA 和 AAA 没有关联,但指数 1 和指数 2 的相应优势比均显着。在所检查的疾病中,只有血脂异常显示 BCAA 的比值比高于指数 1。这些结果揭示了氨基酸代谢对每种生活方式相关疾病风险的独特贡献。进一步分析氨基酸代谢与疾病风险之间的关系可能有助于了解生活方式相关疾病的病理生理学、诊断和预防。

我们的分析显示,PFAA 指数与高血压之间存在中等相关性,而之前的相关性较弱。结果之间的差异可能是由于本研究中受试者数量较多所致。然而,在未来的研究中了解盐摄入量对高血压和 PFAA 谱之间关系的影响将会很有趣。

结论

生物样品的氨基酸分析可用于生成可用于临床诊断的指数,并且是了解各种生理条件下代谢影响的有用工具。尽管分析方法还需要进一步改进,但氨基酸可能是促进特定生理和病理状态营养管理的有用指标。

我们证实了 PFAA 谱和指数作为评估大量亚洲人群中生活方式相关疾病(包括糖尿病、代谢综合征、血脂异常和高血压)风险的标志物的有用性

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