临床与实验心脏病学
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高分辨率 DNA 熔解分析发现 6 个脂质相关基因的常见变异及其与血浆脂质的关联

约翰·F·卡尔奎斯特、杰森·T·麦金尼、本杰明·D·霍恩、尼古拉·J·坎普、丽莎·坎农-奥尔布赖特、约瑟夫·B·穆尔斯坦、保罗·霍普金斯、杰西卡·L·克拉克、克里斯萨·P·莫尔、詹姆斯·J·帕克、扎卡里·P . 尼古拉斯、约翰·A·亨廷豪斯和杰弗里·L·安德森

背景：总胆固醇是最早确定的冠心病（CHD）危险因素之一。我们试图鉴定与脂质代谢相关的六个基因的遗传变异，并估计它们各自对冠心病风险的贡献。

方法：对于 6 个脂质相关基因（LCAT、CETP、LIPC、LPL、SCARB1 和 ApoF），我们使用 Hi-Res Melting® 曲线分析扫描了外显子、5' 和 3' 非翻译区以及供体和受体剪接位点的变异体（HRMCA）并通过循环测序进行确认。健康受试者用于 SNP 发现 (n=64)、单倍型测定/标记 SNP 发现 (n=339) 和脂质关联测试 (n=786)。

结果：在 17,840 个碱基的询问序列中，鉴定出 90 个变异 SNP；19 (21.1%) 之前未报告。34 个变体 (37.8%) 为外显子变体（16 个为非同义变体），28 个变体 (31.1%) 位于内含子-外显子边界，28 个变体 (31.1%) 位于 5' 和 3' 非翻译区域。与循环测序相比，HRMCA 的敏感性为 99.4%，特异性为 97.7%。标记 SNP (n=38) 解释了 6 个基因中 > 90% 的变异，并确定了连锁不平衡 (LD) 组。CETP LD 第 2 组、LIPC LD 第 1 组和第 7 组以及 SCARB1 LD 第 1、3 和 4 组观察到显着有益的血脂特征。CETP LD 第 3 组、LPL LD 第 4 组的风险状况恶化。

结论：这些发现证明了 HRMCA 对于 SNP 发现的可行性、敏感性和特异性。这些基因中鉴定的变异可用于预测脂质相关风险和临床冠心病风险的重新分类。