蛋白质组学与生物信息学杂志
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抽象的

粪肠球菌二元信号转导蛋白-蛋白质相互作用的比较网络分析。

Ranjith N. Kumavath 和 Pratap D

背景：粪肠球菌的蛋白质-蛋白质相互作用网络分析。比较
方法有助于剖析基因功能、潜在信号转导和毒力途径。我们的研究基于使用 STRING 和 HPIDB 数据库进行的蛋白质相互作用预测分析和宿主-病原体相互作用分析，揭示了十种不同粪肠球菌菌株中两种成分信号转导蛋白质-蛋白质相互作用的比较网络分析。大约 30-40 种蛋白质参与粪肠球菌的双组分系统。

结果：计算了蛋白质-蛋白质相互作用的网络参数。几乎所有粪肠球菌网络菌株的拓扑系数都完全遵循幂律分布（相关性）1.000；R 平方）1.000 代表最佳拟合。我们已经找到了一种蛋白质（EF_3329）DNA结合反应调节剂，除了粪肠球菌X86菌株外，它不参与整个蛋白质相互作用网络。我们检测到一个子网络，除了粪肠球菌 D6 之外，与主网络根本没有任何相互作用。

结论：这是一项关于粪肠球菌两组分系统的新颖比较研究，
为进一步分析其他危及生命的病原体中两组分信号转导的蛋白质相互作用提供了有用的资源。进一步的分析揭示了 insilco 抑制剂的筛选，这有助于新药的设计。