蛋白质组学与生物信息学杂志
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比较蛋白质组学和网络分析识别长链脂肪酸信号传导背后的 PKC Epsilon

Tomo Yonezawa、Riho Kurata、Atsushi Tajima、崔晓峰、Hiroki Maruta、Hirofumi Nakaoka、Keiichi Nakajima 和 Hidetoshi Inoko

长链脂肪酸在细胞的生物学功能中具有多种作用，不仅作为能量底物，而且作为细胞膜合成的底物和细胞内信号分子的前体。然而，人们对长链脂肪酸刺激的生物学途径知之甚少。为了确定长链脂肪酸的通路，我们对经过或未经油酸处理的细胞进行了二维凝胶电泳，然后使用PDQuest软件分析了648个蛋白点，并通过统计标准缩小了22个显着变化的点。我们还尝试通过 MALDI-QIT-TOF-MS 和 SWISSPROT 数据库查询来确定这些点。我们鉴定了 11 种蛋白质，并使用蛋白质-蛋白质相互作用数据库中的可用数据集预测了生物网络。这一预测表明，多种蛋白激酶 C (PKC) 是长链脂肪酸信号传导的基础。事实上，油酸刺激了预测的 PKC 通路。在表达阵列中，油酸仅在转录水平上显着上调 PKC epsilon，但不上调其他 PKC。总的来说，我们的蛋白质组学和网络分析表明 PKC epsilon 通路在长链脂肪酸信号传导中发挥着重要作用。