蛋白质组学与生物信息学杂志
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米托蒽醌与人血清白蛋白结合的计算模拟

沙珀·N·汗 (Shahper N. Khan) 和阿萨德·U·汗 (Asad U. Khan)

米托蒽醌（MTX）是临床上使用的抗肿瘤蒽环类药物，通过人血清白蛋白（HSA）转运至靶组织。与该家族的其他成员不同，其毒性较低，因此其结合特性引起了极大的兴趣。蛋白质和配体在 CORINA 的帮助下制备，用 Insight II 质子化，并通过 Gold V 寻找最佳构象。通过对接程序，位点 III 已被指定为具有 MTX 的结合位点，其结合亲和力 (Ka) = 1.58 x 106 mol-1。分子对接计算将 MTX 置于 HSA 的洋地黄毒苷结合位点。发现这种相互作用在热力学上是有利的 (?G° = -35.53 KJmol-1)。对 HSA 上 MTX 结合位点的进一步分析表明，促成这种结合的相互作用类型是疏水接触，氢键和静电相互作用。这项研究以统一的方式呈现了结合机制，简单但严格，更直接，更可靠且信息丰富。