免疫组学研究
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抽象的

糖基化在确定 T 细胞表位长度和结构中的关键作用

Tam?s G Szab?、Robin Palotai、P?ter Antal、Itay Tokatly、L?szl？T?thfalusi、Ole Lund、Gy?​​rgy Nagy、Andr?s Falus 和 Edit I Buz

背景：我们采用组合计算机方法研究了 T 细胞表位和自身抗原的糖基化。目前的系统生物学分析是通过当前可用的数据库（代表完整的蛋白质组、已知的人类 T 细胞表位和自身抗原）以及糖基化预测工具实现的。结果：我们分析了从免疫表位数据库中提取的人 T 细胞表位序列的可能糖基化。我们的分析表明，与全长 SwissProt 条目相比，经过实验验证的 T 细胞表位中只有极小部分可能是 N 糖基化或 O 糖基化（分别为 2.26% 和 1.22%）。对从自身抗原数据库中提取的条目进行贝叶斯分析表明 N-糖基化和自身抗原性之间存在相关性。对随机生成序列的分析表明，糖基化概率也受肽长度的影响。我们的数据表明，肽糖基化的缺乏（这一特征可能有利于 T 细胞的有效识别）可能导致短肽成为 T 细胞表位的选择性优势。T 细胞表位的长度位于决定特异性和糖基化概率的曲线的交点处。因此，天然存在的T细胞表位的长度范围可以确保最大的特异性和最小的糖基化概率。结论：这种生物信息学方法的研究结果揭示了进化过程中可能影响适应性免疫的基本因素。