糖类组学与脂质组学杂志

糖类组学与脂质组学杂志
开放获取

国际标准期刊号: 2153-0637

抽象的

CellMiner 中当前和即将推出的 NCI-60 分析工具:数据集成和系统药理学资源

威廉·C·莱因霍尔德

CellMiner 网络应用程序;一套工具,可快速访问 NCI-60 可用的多种形式的分子和药理学数据。这些工具还有助于以非生物信息学家可行的方式整合这些高通量数据。集成工具可在“NCI-60 分析工具”部分访问。其中包括“细胞系特征”工具,它为 NCI-60 提供 i) 转录水平、ii) 化合物活性和 iii) microRNA 水平。将演示对外显子组测序数据的访问,包括使用“DNA 图形输出:外显子组测序”。反过来,可以使用“交叉相关”工具整合多达 150 个基因(转录本水平)、microRNA 水平和药物活性的各个形式的数据。还可以使用“模式比较”来整合数据,它允许输入任何模式(对于 NCI-60),并根据该模式将所有基因转录本和 microRNA 水平以及化合物活性关联起来。还演示了几种正在开发的工具。第一个是用于确定 DNA 拷贝数变异的“aCGH 拷贝数”。其次是“遗传变异求和”,它提供了多达 150 个基因通路中突变的求和。第三个是“基因变异与药物可视化”,它提供了基因变异与药物关系的快速可视化。这些工具中的每一个都允许用户以特定于他们的专业知识和兴趣领域的方式搜索潜在关系。不需要计算机科学或生物信息学方面的专业知识。科学公众可以免费获得这些数据。并根据该模式将所有基因转录本和 microRNA 水平以及化合物活性关联起来。还演示了几种正在开发的工具。第一个是用于确定 DNA 拷贝数变异的“aCGH 拷贝数”。其次是“遗传变异求和”,它提供了多达 150 个基因通路中突变的求和。第三个是“基因变异与药物可视化”,它提供了基因变异与药物关系的快速可视化。这些工具中的每一个都允许用户以特定于他们的专业知识和兴趣领域的方式搜索潜在关系。不需要计算机科学或生物信息学方面的专业知识。科学公众可以免费获得这些数据。并根据该模式将所有基因转录本和 microRNA 水平以及化合物活性关联起来。还演示了几种正在开发的工具。第一个是用于确定 DNA 拷贝数变异的“aCGH 拷贝数”。其次是“遗传变异求和”,它提供了多达 150 个基因通路中突变的求和。第三个是“基因变异与药物可视化”,它提供了基因变异与药物关系的快速可视化。这些工具中的每一个都允许用户以特定于他们的专业知识和兴趣领域的方式搜索潜在关系。不需要计算机科学或生物信息学方面的专业知识。科学公众可以免费获得这些数据。还演示了几种正在开发的工具。第一个是用于确定 DNA 拷贝数变异的“aCGH 拷贝数”。其次是“遗传变异求和”,它提供了多达 150 个基因通路中突变的求和。第三个是“基因变异与药物可视化”,它提供了基因变异与药物关系的快速可视化。这些工具中的每一个都允许用户以特定于他们的专业知识和兴趣领域的方式搜索潜在关系。不需要计算机科学或生物信息学方面的专业知识。科学公众可以免费获得这些数据。还演示了几种正在开发的工具。第一个是用于确定 DNA 拷贝数变异的“aCGH 拷贝数”。其次是“遗传变异求和”,它提供了多达 150 个基因通路中突变的求和。第三个是“基因变异与药物可视化”,它提供了基因变异与药物关系的快速可视化。这些工具中的每一个都允许用户以特定于他们的专业知识和兴趣领域的方式搜索潜在关系。不需要计算机科学或生物信息学方面的专业知识。科学公众可以免费获得这些数据。它提供了多达 150 个基因通路中突变的总和。第三个是“基因变异与药物可视化”,它提供了基因变异与药物关系的快速可视化。这些工具中的每一个都允许用户以特定于他们的专业知识和兴趣领域的方式搜索潜在关系。不需要计算机科学或生物信息学方面的专业知识。科学公众可以免费获得这些数据。它提供了多达 150 个基因通路中突变的总和。第三个是“基因变异与药物可视化”,它提供了基因变异与药物关系的快速可视化。这些工具中的每一个都允许用户以特定于他们的专业知识和兴趣领域的方式搜索潜在关系。不需要计算机科学或生物信息学方面的专业知识。科学公众可以免费获得这些数据。

Top