蛋白质组学与生物信息学杂志
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通过贝叶斯分区模型检测隐匿性乙型肝炎感染中的乙型肝炎病毒氨基酸序列突变

连志超、田齐宁、刘阳、Valeria Cento、Romina Salpini、Carlo Federico Perno、Valentina Svicher、陈刚、李聪和张静

背景：随着技术的进步，已经报道了许多乙型肝炎病毒（HBV）感染，其中病毒DNA存在于肝脏或血浆中，但血浆中没有同时检测到HBsAg，并被称为隐匿性乙型肝炎感染。欧比）。不幸的是，迄今为止，OBI 的病因和发病机制仍然难以捉摸，并且导致 OBI 发生的 HBV 序列的遗传特征仍然知之甚少。

方法：收集358例C基因型（330例慢性感染者和28例隐匿感染者）和107例D基因型（83例慢性感染者和24例隐匿性感染者）HBV逆转录酶（RT）氨基酸序列。除了贪婪搜索（一种新颖的统计方法）之外，还应用贝叶斯可变分区模型来精确定位氨基酸突变分别在基因型 C 和基因型 D 中协同区分 OBI 样本与慢性感染样本的位置。

结果：在基因型C（表中列出的高阶位置组合）和基因型D（位置126+138、129+131和138+139）中分别发现了几个区分和相关位置。通过比较C基因型和D基因型之间这些位置的氨基酸分布，发现这两种HBV基因型中有6个位置组合具有明显不同的氨基酸分布。

结论：本文通过研究HBV RT氨基酸序列突变，进一步了解HBV序列突变与两种HBV基因型OBI差异之间的相关性。与其他传统方法不同，基于贝叶斯的方法能够分析位置的高阶组合。