蛋白质组学与生物信息学杂志
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抽象的

基于凝集素微阵列的细胞糖蛋白差异分析数据挖掘系统的开发

Atsushi Kuno、Yoko Itakura、Masashi Toyoda、Yoriko Takahashi、Masao Yamada、Akihiro Umezawa 和 Jun Hirabayashi

凝集素微阵列是一种新兴技术，能够以直接、快速和灵敏的方式进行多重聚糖分析。到目前为止，还没有强大的系统可用于有效的数据挖掘以实现差异分析，这是生物标志物研究的有效方法。在本文中，我们以小鼠胚胎癌和胚胎干细胞及其与视黄酸的分化形式为例，描述了基于蛋白质组学的聚糖相关生物标志物发现的实用策略。数据由微阵列系统在增益合并过程后使用最大归一化程序进行处理，然后进行主成分分析。