蛋白质组学与生物信息学杂志
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使用 iTRAQ 定量对少突胶质细胞瘤和星形细胞瘤进行差异蛋白质组学分析

林世德、李靖哲、王鹏、臧玉杰、赵廷宝

背景：星形细胞瘤和少突胶质细胞瘤是原发性中枢神经系统（CNS）肿瘤的两种组织学亚型。由于细胞结构的高度变异性和缺乏准确的诊断生物标志物，区分星形细胞瘤和少突胶质细胞瘤在临床上仍然具有挑战性。方法：通过 2DLC/MS/MS 分析星形细胞瘤和少突胶质细胞瘤临床标本的总蛋白裂解物，并通过同量异位标签相对和绝对定量 (iTRAQ) 进行定量。通过 Ingenuity Pathway Analysis (IPA) 软件进一步分析差异表达的蛋白质。最后，通过蛋白质印迹验证了潜在生物标志物的表达水平。结果：共鉴定出 1856 个蛋白质。其中，与少突神经胶质瘤相比，星形胶质瘤标本中有83种蛋白质增加，82种蛋白质减少。我们的生物信息学研究表明，星形细胞瘤中的这种蛋白质谱变化更有可能增强细胞增殖、迁移和血管生成。此外，通路分析表明，星形细胞瘤和少突胶质细胞瘤中 Rho 家族 GTPases 通路成分的蛋白水平存在显着差异。最后，GTP酶Rho家族的两个成员，细胞分裂控制蛋白42同源物（CDC42）和转化蛋白RhoA（RHOA）分别在星形细胞瘤和少突胶质细胞瘤中高表达。讨论：差异蛋白质组分析可验证区分星形细胞瘤和少突胶质细胞瘤。尤其是 GTPases 的 Rho 家族的两个成员 CDC42 和 RHOA，将成为反映这两种疾病病理特征的潜在指标。