蛋白质组学与生物信息学杂志
开放获取

抽象的

iTRAQ 对人微血管内皮细胞的差异定量蛋白质组学 1 揭示 Palladin 是 TGF-β1 诱导的内皮间质转化过程中的新生物标志物

Marta Stasiak、Katarzyna Gawrys、Marcin Popielarski、Radoslaw Bednarek、Maciej Studzian、Ewa Sitkiewicz、Janusz Szemraj 和 Maria Swiatkowska

该研究利用全局定量蛋白质组学来研究通过转化生长因子-β (TGF-β) 诱导内皮-间质转化 (EndMT) 背后的分子机制。Orbitrap Velos 质谱仪和 iTRAQ（基于标记的分析）用于对经 TGF-β1 处理或未处理的人类微血管内皮细胞 1 (HMEC-1) 的两种蛋白质组进行全面定量比较。iTRAQ 分析鉴定出 TGF-β1 诱导的 EndMT 早期阶段有 43 个差异表达蛋白。在 5522 个已鉴定的蛋白质中，有 26 个下调，17 个上调，包括 Palladin、POTE I、torsin A 和核孔蛋白 (NDC1) 等蛋白质。Palladin 的进一步分析表明，其 mRNA 和蛋白质表达增加，以响应 TGF-β 和 Snail 转录因子。

生物学意义：内皮向间质转化是肌成纤维细胞的可能来源，肌成纤维细胞在纤维化的发病机制中发挥着至关重要的作用。EndMT 参与各个器官的组织纤维化过程。TGF-β 家族生长因子参与 EndMT 的启动。TGF-β激活的细胞内级联反应导致内皮细胞向间充质细胞的显着表型变化尚未完全阐明。TGF-β 启动的下游信号通路导致 Snail1 转录阻遏蛋白的强烈上调。我们的蛋白质组学数据表明，TGF-β 诱导的 EndMT 会导致蛋白质谱的改变，更具体地说，palladin 的上调。这种上调是由 Snail 转录因子和 GSK-3 β 信号激酶介导的。