蛋白质组学与生物信息学杂志

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国际标准期刊号: 0974-276X

抽象的

利用低分子量血清蛋白质组质谱法发现小鼠炭疽模型中的传染病生物标志物

Aarthi Narayanan、Weidong Zhou、Mark Ross、Jane Tang、Lance Liotta、Emanuel Petricoin、Fatah Kashanchi、Charles Bailey 和 Serguei Popov

在小鼠模型中测试了一种基于质谱 (MS) 的新型方法,用于鉴定血液蛋白质组循环低分子质量 (LMM) 部分 (<25 kDa) 中宿主衍生的生物标志物 (BM)。DBA2/J 小鼠腹膜内用对 DBA/2 小鼠有毒力的产毒炭疽杆菌 Sterne 菌株 (pXO1 + 、 pXO2 - ) 或不产毒、无毒力的 Delta Sterne 菌株 (pXO 1 - 、 pXO2 - ) 的孢子进行攻击。 )。在多个时间点获取血清样品,并通过连续流变性凝胶电泳分离,然后进行考马斯染色,以隔离 LMM 档案以供后续 MS 鉴定。来自 200 多种蛋白质的肽片段在致死和非致死挑战之间表现出低方差差异丰度。MS 分析中的几种蛋白质通过蛋白质印迹进行了二次验证。总共 10 种测试蛋白质中 6 种蛋白质(碳酸酐酶 2、腺苷酸激酶 1、过氧化酶 2、UMP-CMP 激酶、Ras 相关 C3 肉毒杆菌底物 1 和结精蛋白)的血清丰度与已确定的炭疽病高度一致和死亡率,因此使它们成为宿主源性炭疽病相关 BM 的潜在候选者。这些 BM 被证明是“有弹性的”,因为它们在强力霉素治疗小鼠血清中的丰度水平对治疗干预有反应,因此使其成为监测现有和新型治疗方案疗效的有用工具。总共 10 种测试蛋白中的 UMP-CMP 激酶、Ras 相关 C3 肉毒杆菌底物 1 和 detrin)与已确定的炭疽病和死亡率高度一致,因此使它们成为宿主源性炭疽病相关 BM 的潜在候选者。这些 BM 被证明是“有弹性的”,因为它们在强力霉素治疗小鼠血清中的丰度水平对治疗干预有反应,因此使其成为监测现有和新型治疗方案疗效的有用工具。总共 10 种测试蛋白中的 UMP-CMP 激酶、Ras 相关 C3 肉毒杆菌底物 1 和 detrin)与已确定的炭疽病和死亡率高度一致,因此使它们成为宿主源性炭疽病相关 BM 的潜在候选者。这些 BM 被证明是“有弹性的”,因为它们在强力霉素治疗小鼠血清中的丰度水平对治疗干预有反应,因此使其成为监测现有和新型治疗方案疗效的有用工具。

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