蛋白质组学与生物信息学杂志
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与聚类转录本相关的亚型相互作用的多样性：系统文献分析

Şenay Kafkas、Ekrem Varoğlu、Dietrich Rebholz-Schuhmann 和 Bahar Taneri

现有的蛋白质-蛋白质相互作用数据库仅涵盖相互作用组的一部分，并且蛋白质亚型的相互作用信息代表性不足。这导致缺乏关于蛋白质亚型的功能相似性以及转录多样性对蛋白质相互作用网络的影响的信息。我们提出了一种全面的自动化文献分析，提取涉及与具有高序列相似性的转录物簇相关的人类蛋白质亚型的相互作用，并将它们传递到名为 TBIID 的数据库中以进行知识发现。我们通过分析 TBIID 中相互作用伙伴的分布来测量聚集转录本中异构体的相互作用变异性。几乎所有分析的簇（99％）都包含具有独特伙伴的同种型，表明同种型专门用于形成独特的相互作用，从而实现功能多样性，这与公共资源的结果相似。TBIID 可在 http://tbiid.emu.edu.tr 上找到，其中包含未来实验的最相关候选者，重点是了解异构体相互作用网络和由此产生的功能影响。