蛋白质组学与生物信息学杂志
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使用 HTVS 和药效图谱靶向主要蛋白酶的药物再利用方法：对于大多数无力偿债的抗 SARS-CoV-2 药物来说，这是一个令人放心的特殊路线

Virupaksha A. Bastikar、Pramodkumar Gupta、Jaiprakash N. Sangshetti、Alpana V. Bastikar、Santosh S. Chhajed

新型冠状病毒肺炎 (COVID-19) 疫情自 2019 年 12 月在中国武汉爆发以来，已在全球范围内造成了广泛的危害。迄今为止，还没有发现有希望的药物用于治疗疾病。有鉴于此，科学家们阐明了SARS-CoV-2病毒中蛋白质的X射线结构。这些可以作为迫切需要的药物设计的可能药物靶点。该病毒的主要蛋白质之一是其主要蛋白酶Mpro，其负责产生病毒的多蛋白。在本研究中，我们使用主要蛋白酶作为药物设计和重新利用 COVID-19 的靶标。为了开发一种快速有效的病毒治疗方法，采用了两种方法。通过计算机模拟重新利用药物一种方法是对现有 FDA 批准的药物进行对接分析，另一种方法是从 ZINC 数据库中针对主要蛋白酶进行分子高通量筛选。使用两种对接方案——快速对接算法来筛选命中或先导分子，然后是基于模拟的分子动力学对接程序以优化获得的命中。我们可以观察到针对主要蛋白酶的基于明确支架的结合亲和力。这些支架是叶黄素、类固醇、吗啡和喹诺酮、CPT。噻替派被认为是具有最高结合亲和力的最佳对接分子。叶黄素、β-胡萝卜素、丁丙诺啡等独特分子已被鉴定出，可用作对抗 SARS-CoV-2 的重新利用药物。