生物医学数据挖掘国际期刊

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国际标准期刊号: 2090-4924

抽象的

去神经引起的萎缩过程中骨骼肌蛋白质组的动态变化

马库斯·克鲁格

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神经元刺激的丧失会增强蛋白质的分解并减少蛋白质的结合,从而导致快速的大量死亡。为了解释腐烂肌肉中发生的病理生理变化,我们利用稳定同位素标记和质谱法来精确测量骨骼肌坐骨神经区域去神经引发腐烂期间蛋白质关节的变化。此外,小鼠接受含有 13C6 赖氨酸的 SILAC 饮食四天、七天或十一天,以计算去神经支配肌肉和对照肌肉中蛋白质组合的相对程度。通过免疫亲和力进展对泛素剩余肽 (K-ε-GG) 进行分析,以识别泛素蛋白酶体途径的可能底物。除了蛋白质关节分析之外,我们还利用心跳 SILAC 命名方式来识别对照肌肉和去神经肌肉之间的 Lys6 连接率差异。二甘氨酸残基的增强区分了 2100 个内源性泛素化位点,并发现了去神经过程中代谢和肌原纤维蛋白二甘氨酸特征,包括肌球蛋白实质链 (MyHC)、肌球蛋白和肌联蛋白。

利用任意的林地方法对这些具有已知 atrogenes 的蛋白质组数据集进行仔细检查,发现 92 种蛋白质受 atrogene 样指导原则约束,这些蛋白质最近尚未与去神经促进的衰退直接相关。蛋白质融合和蛋白质组学信息的相关性表明,根据去神经支配,显性蛋白质的上调基本上是通过蛋白质调整来完成的。这项研究对生物体固体腐烂过程中的蛋白质连接、融合和泛素标记进行了主要的综合检查。

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