分子成像与动力学杂志
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C 末端截断对 α-突触核蛋白聚集倾向的影响 - 平均力研究的潜力

艾里·桑吉夫和文卡塔·萨蒂什·库马尔·马塔帕蒂*

α-突触核蛋白是一种本质上无序的蛋白质，在帕金森病 (PD) 中发挥着重要作用。据报道，α-突触核蛋白的几种家族变异与遗传性帕金森病有关。几项研究强调了截短形式的 α-突触核蛋白 C 末端与野生型 α-突触核蛋白 (WT α- syn) 在路易体疾病患者中的存在和关联，其水平要高得多，并且发现它们可以降低还原性能力并可能导致α-突触核蛋白的永久氧化。为了了解 C 端截断对 WT α-syn 聚集倾向的影响，它们之间的分子间相互作用至关重要。在这里，我们展示了 WT α-syn 与其三个 C 末端截断 95 (α-syn 95)、120 (α-syn 120) 和 123 (α-syn 123) 之间的相互作用，使用分子动力学模拟和平均力研究 (PMF) 的潜力。从 PMF 研究中，我们观察到 C 端截短 120 (α-syn 120) 与 WT a-syn 的结合比其他截短形式的 α-突触核蛋白更强。我们还注意到，与其他异质二聚体 (WT α-) 相比，异质二聚体 (WT α-syn-α-syn 120) 的氢键数量更多、几何形状互补得分更高、界面残基数量和界面面积更大顺 - α-顺 95/123）。因此我们可以推断，在α-syn 95、α-syn 120和α-syn 123中，α-syn 120与WT α-syn表现出更多关联。这是因为在 α-syn 120 中，与 α-syn 123 相比，去除了更多氨基酸。相比之下，α-Syn 95 由于不存在整个 C 末端区域，因此与 WT α-syn 的相互作用较少。