蛋白质组学与生物信息学杂志
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抽象的

通过新型二元双聚类算法有效挖掘基因表达数据

海法·本·萨贝尔和穆拉德·埃卢米

在本文中，我们提出了四种新算法，称为 BiBin Alter、BiBin Cons 和 BiBin Sim，用于二元微阵列数据的双聚类。有一些新颖的替代方法可以从稀疏二进制数据集中提取双簇。我们的算法基于迭代行列聚类组合 (IRCCC) 和分而治之 (DC) 方法、Bi Max 初始化和 Cro Bin 评估函数。应用于二进制合成数据集时，我们的算法优于二进制微阵列数据的其他双聚类算法。可以检测具有不同行数和列数的双簇，从多行到少列以及从少行到多列。我们的算法允许用户引导搜索特定维度的双簇。