抗病毒与抗逆转录病毒杂志
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临床环境中丙型肝炎全口服直接作用抗病毒治疗耐药相关变体的演变

阿莱西亚·赖、劳拉·米拉佐、安娜莉莎·伯格纳、毛里齐奥·波拉诺、弗朗西斯卡·宾达、马可·弗兰泽蒂、瓦莱里娅·米凯利、保拉·朗齐、吉安古列尔莫·泽恩德、萨尔瓦托·索利马、马西莫·加利和克劳迪娅·巴洛塔

由于丙型肝炎病毒（HCV）的高度变异性，表征不同基因型中耐药相关突变（RAV）到直接作用抗病毒药物（DAA）的体内进化可能很重要。
通过下一代测序 (NGS) 对 74 名开始 DAA 方案的 HCV 感染患者进行了 NS3-、NS5A- 和 NS5B-HCV 替代研究。分析了频率为 1% 和 15% 的 RAV。
全球范围内，分别有 43、15、12 和 4 名患者感染亚型 1a、1b、基因型 4 和亚型 3a。大多数患者 (64.8%) 患有肝硬化，70.3% 患有 HIV 合并感染，14.9% 患有 DAA。对于当时可用的任何 NS3、NS5B 和 NS5A 抑制剂，RAV 的总体基线患病率分别为 74.3%、52.2%、45.9% 和 36.8%，当使用仅考虑与正在进行的治疗方案相关的突变。在 1a 亚型中检测到的突变比例最高（81.4%，p=.026），特别是在 NS3 区域（76.9%，p<.001）。在 7 名失败患者中，57.1% 的基线序列显示替换为大多数物种。在病毒复发时，两名患者积累了更多的 RAV，这些 RAV 甚至在基线时作为少数变异也缺失了
尽管几乎一半的患者在基线时表现出自然替代，但这些替代并没有引起对 DAA 的耐药性。我们的研究表明，低截止值的 NGS 的作用有限，因为次要物种的检测似乎无法预测失败时抗性变异的选择。治疗前 RAV 对 DAA 实现持续病毒学应答的影响有限。