蛋白质组学与生物信息学杂志
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硫酸铵分级沉淀血浆蛋白质组：白血病和地中海贫血的案例研究

Sutapa Saha、Suchismita Halder、Dipankar Bhattacharya、Debasis Banerjee 和 Abhijit Chakrabarti

人血浆蛋白质组是疾病生物标志物的综合来源。然而，其组成蛋白>10个数量级的动态浓度范围需要在发现生物标志物之前从血浆中去除丰富的蛋白质。我们的目标是开发一种简单的方法来消耗最丰富的蛋白质，例如白蛋白和免疫球蛋白，有效促进血浆样品中差异调节蛋白的鉴定。在通过 MALDI-TOF/TOF 串联质谱法鉴定蛋白质后，我们采用基于硫酸铵的血浆预分级，然后进行二维凝胶电泳 (2DGE)，将正常蛋白质与患者血浆样本中的蛋白质进行比较。使用来自原始血浆的 20% 硫酸铵对血浆样品进行分级沉淀，使 2DGE 后蛋白质点的数量增加一倍，并鉴定出 87 种独特的蛋白质，包括几种低丰度蛋白质。对患有血液病的患者血浆样本进行分级沉淀的案例研究例如，白血病和地中海贫血表明了这种预分级在检测差异调节蛋白质中的效用。