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与肺癌相关的四个或更少关键基因的功能效应以及新机器学习分类器检测到的新亚型

张正军

寻找与肺癌在生物学上直接或间接相关的基因一直备受关注，许多与肺癌直接相关的基因已被报道。然而，尚未证实那些已发表的“关键”基因是否真正对肺癌的形成至关重要，即它们的有用信息可能非常有限。因此，寻找必需基因仍然是肺癌研究的一个具有挑战性的问题。使用最近开发的差异表达基因检测中的竞争线性因子分析方法，我们将肺癌关键基因检测的研究推进到统一的信息水平。在一项肺腺癌 (LUAD) 和一项鳞状细胞肺癌 (LUSC) 研究中，以 100% 敏感性和 100% 特异性检测到一组常见的四种基因及其功能效应在肿瘤和非肿瘤样本中差异表达。 ）（两个北美队列，有 20429 个基因，分别有 576 个和 552 个样本）。另外两项分析在一项非小细胞肺癌（NSCLC，一个包含 20356 个基因和 156 个样本的欧洲队列）研究中也获得了 97.8% 的敏感性和 100% 的特异性，以及 100% 的敏感性和 95% 的特异性（在一项 ALK 阳性和 EGFR/KRAS/ALK 阴性肺腺癌研究中（20 个非肿瘤样本中的 1 个）（LUAD，一个包含 20356 个基因和 224 个样本的日本队列）。有一些共同的基因，但功能作用不同，在两个北美队列和一个欧洲队列以及北美队列和日本队列之间的每组四个基因中。这些结果表明，基于四基因的分类器对于不同类型的肺癌和不同种族群体来说是稳健且准确的。四个基因的功能效应显着揭示了 LUAD 和 LUSC 之间的其他机制（奥秘）。这组四个基因及其功能效应被认为对于肺癌研究和实践至关重要。这些基因的功能效应自然地将患者分为不同的组（超过七种亚型）。亚型信息对于个性化治疗很有用。新发现可以推动新的肺癌研究朝着更有针对性和更有针对性的方向进行，以拯救生命、保护人民、