蛋白质组学与生物信息学杂志
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抽象的

抑制的基因表达谱

Arivusudar Marimuthu、Harrys KC Jacob、Aniruddha Jakharia、Yashwanth Subbannayya、Shivakumar Keerthikumar、Manoj Kumar Kashyap、Renu Goel、Lavanya Balakrishnan、Sutopa Dwivedi、Swapnali Pathare、Jyoti Bajpai Dikshit、Jagadeesha Maharudraiah、Sujay Singh、Ghantasala S Same尔库马尔·M·维贾亚库玛、Kariyanakatte Veeraiah Veerendra Kumar、Chennagiri Shri

拖是全球男性和女性癌症死亡的第二大原因。进行全基因组基因表达分析，促进腺癌组织与邻近正常组织相比的差异表达基因。我们使用安捷伦代表约41,000个基因的全人类基因组寡采用双色微阵列分析直接比较肿瘤和正常组织之间的基因表达。通过这种方法，我们鉴定了一些先前已知的候选基因以及一些新的候选基因Testican-1 (SPOCK1)是一种在肿瘤中表达上调10倍的新型分子。利用组织微阵列，我们通过免疫组织化学染色验证了testican-1的表达。它在56% (160/282) 的表达测试病例中过度表达。完成分析确定了几个网络，其中SPOCK1是应答基因中最复杂的网络之一。通过基因富集分析，我们发现一些涉及细胞粘附和细胞增殖的基因有明显的上调，​​而与通路相对应的基因显着着上调。本研究中鉴定的差异表达基因是胃癌的候选生物标志物。我们发现一些涉及细胞粘附和细胞肿胀的基因显着上调，而与通路相对应本研究中鉴定的差异表达基因是胃腺癌的生物候选标志物。我们发现一些涉及细胞粘附和细胞增殖的基因显着上调，而与途径途径相对应的基因则显着本研究中鉴定腺体的差异表达基因是胃癌的候选生物标志物。