抗病毒与抗逆转录病毒杂志
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南非约翰内斯堡2 型单纯疱疹病毒UL23胸苷激酶的遗传特征

艾蒂安·E​​·穆勒 (Etienne E Müller)、马赫拉普·P·马古阿 (Mahlape P Magooa) 和大卫·A·刘易斯 (David A Lewis)

2 型单纯疱疹病毒 (HSV-2) 目前是全球和南非生殖器溃疡病 (GUD) 的主要原因。HSV-2 感染最常使用阿昔洛韦 (ACV) 治疗，阿昔洛韦是一种鸟苷核苷类似物，需要被病毒编码的胸苷激酶 (TK) 磷酸化。对ACV的抗性主要是由于编码TK的病毒UL23基因发生突变。2008 年底，南非将 ACV 作为 GUD 一线症状管理治疗方案的一部分。为了评估在生殖器溃疡标本中检测到的 HSV-2 病毒颗粒中 TK 相关的 ACV 耐药性的流行率，在治疗前和治疗后-引入ACV，我们对254份HSV-2阳性样本的UL23基因进行了扩增和完全测序，这些样本取自2007年至2011年在约翰内斯堡进行的GUD病原学调查的参与者，南非。我们在分析的 UL23 基因中发现了 63 个核苷酸突变，导致 30 个沉默突变和 32 个氨基酸变化。这些氨基酸变化的很大一部分（41%）是由于先前描述的敏感和耐药 HSV 菌株中发生的天然多态性造成的。此外，我们在 30 个样品中发现了 19 个未知的氨基酸变化，这些变化以前从未被描述过。检测到的所有突变均位于公认的 TK 保守域之外，ACV 抗性突变通常发生在该区域。在分析的 UL23 基因中没有发现移码突变或引起终止密码子的突变。重要的是，在添加 ACV 作为 GUD 的一线治疗后，没有发现 HSV-2 中已知的 ACV 耐药突变的证据。这导致了 30 个沉默突变和 32 个氨基酸变化。这些氨基酸变化的很大一部分（41%）是由于先前描述的敏感和耐药 HSV 菌株中发生的天然多态性造成的。此外，我们在 30 个样品中发现了 19 个未知的氨基酸变化，这些变化以前从未被描述过。检测到的所有突变均位于公认的 TK 保守域之外，ACV 抗性突变通常发生在该区域。在分析的 UL23 基因中没有发现移码突变或引起终止密码子的突变。重要的是，在添加 ACV 作为 GUD 的一线治疗后，没有发现 HSV-2 中已知的 ACV 耐药突变的证据。这导致了 30 个沉默突变和 32 个氨基酸变化。这些氨基酸变化的很大一部分（41%）是由于先前描述的敏感和耐药 HSV 菌株中发生的天然多态性造成的。此外，我们在 30 个样品中发现了 19 个未知的氨基酸变化，这些变化以前从未被描述过。检测到的所有突变均位于公认的 TK 保守域之外，ACV 抗性突变通常发生在该区域。在分析的 UL23 基因中没有发现移码突变或引起终止密码子的突变。重要的是，在添加 ACV 作为 GUD 的一线治疗后，没有发现 HSV-2 中已知的 ACV 耐药突变的证据。这些氨基酸变化的很大一部分（41%）是由于先前描述的敏感和耐药 HSV 菌株中发生的天然多态性造成的。此外，我们在 30 个样品中发现了 19 个未知的氨基酸变化，这些变化以前从未被描述过。检测到的所有突变均位于公认的 TK 保守域之外，ACV 抗性突变通常发生在该区域。在分析的 UL23 基因中没有发现移码突变或引起终止密码子的突变。重要的是，在添加 ACV 作为 GUD 的一线治疗后，没有发现 HSV-2 中已知的 ACV 耐药突变的证据。这些氨基酸变化的很大一部分（41%）是由于先前描述的敏感和耐药 HSV 菌株中发生的天然多态性造成的。此外，我们在 30 个样品中发现了 19 个未知的氨基酸变化，这些变化以前从未被描述过。检测到的所有突变均位于公认的 TK 保守域之外，ACV 抗性突变通常发生在该区域。在分析的 UL23 基因中没有发现移码突变或引起终止密码子的突变。重要的是，在添加 ACV 作为 GUD 的一线治疗后，没有发现 HSV-2 中已知的 ACV 耐药突变的证据。检测到的所有突变均位于公认的 TK 保守域之外，ACV 抗性突变通常发生在该区域。在分析的 UL23 基因中没有发现移码突变或引起终止密码子的突变。重要的是，在添加 ACV 作为 GUD 的一线治疗后，没有发现 HSV-2 中已知的 ACV 耐药突变的证据。检测到的所有突变均位于公认的 TK 保守域之外，ACV 抗性突变通常发生在该区域。在分析的 UL23 基因中没有发现移码突变或引起终止密码子的突变。重要的是，在添加 ACV 作为 GUD 的一线治疗后，没有发现 HSV-2 中已知的 ACV 耐药突变的证据。