蛋白质组学与生物信息学杂志
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影响艾滋病治疗方案成功与失败的基因突变

乔治·托菲克、朱迪·蒙肖尔、萨米拉·凯图拉、法迪·托菲克、弗兰克·格拉齐亚诺、约翰·维纳和海伦娜·佐西斯

最近，基因型测试（识别病毒突变及其相关的耐药性）已成为在建议替代治疗方案之前识别耐药性的流行程序。

由于主要的耐药因素与病毒突变的频率相关，因此许多研究人员已经探索了HIV在特定核苷酸序列位置处的突变频率，以响应不同类型的药物治疗。然而，只有少数论文讨论了导致患者对特定类型药物治疗产生积极反应的主要遗传特征。

利用现有的临床耐药性库，我们能够确定与蛋白酶抑制剂 (PI) HIV/AIDS 药物治疗方案的成功和失败相关的 HIV 蛋白酶 (PR) 酶中最常见的突变。在识别与 PR 抑制剂药物治疗方案阳性反应相关的基因序列时，我们考虑了从斯坦福 HIV 耐药数据库中选取的总共 2,079 份患者记录。我们表明，对蛋白酶抑制剂治疗有积极反应的患者在其 HIV 核苷酸序列的特定位置始终保持特定的核酸碱基。当将从对 PI 治疗反应不佳的患者组获得的病毒序列与从反应良好的患者相同位置的病毒序列进行比较时，