糖类组学与脂质组学杂志
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抽象的

缠结移动组中 MITE 的基因组规模排序和表征

杨国军

微型反向重复转座元件（MITE）因其高拷贝数和神秘的身份而成为有趣的转座元件（TE）。尽管它们在基因组中的 DNA 含量百分比较低，但它们的大量拷贝会扰乱基因组稳定性并导致重要的遗传变异。从历史上看，MITE家族经常是单独发现的，这种做法无法跟上大规模基因组测序的步伐。MITE 家族的自动化全基因组发现及其表征是可取的。我们开发了从 MITE 发现到基因组规模 MITE 详细分析的完整流程。使用该流程，我们对多个最近发布的作物基因组中的 MITE 家族进行了深入分析。这些分析揭示了 MITE 家族的多样性及其在宿主基因组中的进化。我们还预测了可能负责某些 MITE 家族动员的转座酶。这些 MITE 家族有可能用作改良这些作物物种的遗传标记。