遗传工程的进展
开放获取
国际标准期刊号: 2169-0111
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塔赫雷·阿林贾德
在本次检查中，通过 15 种基本抗性品质评估了水温和生态变量对淡水虾（罗氏沼虾）不易受影响的品质的影响。质量是根据我们过去对罗氏沼虾转录组信息和蛋白质组的调查来挑选和规划的。在淡水虾牧场的原生栖息地进行了各种温度对淡水虾影响的实验室测试。根据规范和非标准的管理和硬件实践，选择了两个不同的牧场进行检查。在一天中的不同时间段、24°C 至 32°C 的不同水温下进行了各种测试。通过在三个独特的器官（血清、肝胰腺和肌肉）中应用不同质量的关节分析（Fluidigm Biomark HD），集中了淡水虾抗热击晕系统和板系统的质量气候关系。结果证实水温升高直接影响淡水虾的免疫反应。同样，通过差异质量清晰度检查，还检查了不同水温对淡水虾血清、肝胰腺和肌肉质量清晰度的影响。三个集合的质量表达信息的相关性表明，与温度升高相比，不易受影响的途径编码质量基本上被下调，而代谢物编码质量基本上被上调。我们的调查发现凝集素途径中新的质量关联，即速凝素作为淡水虾天然压力标记的另一个潜在竞争者质量。这项研究还提供了关于自然压力下巨型新水虾安全途径差异表达的重要数据，这将有助于通过利用从过去的研究中获得的转录组信息中规划的 15 种特性，提高对该物种的质量气候关联的理解。除了，
最近，高通量创新，例如尖端测序（NGS）已经兴起，并广泛应用于基因组和转录组研究。NGS 创新同样可用于检查不同组织或某些条件下的差异质量表达，例如压力和微生物污染以及模型和非模型生命形式。对斑节对虾、凡纳滨对虾、中国明对虾、墨吉明对虾和日本对虾等对虾的转录组学读数可用于研究组织显性连接、压力反应和病毒性疾病。此外，由于副溶血弧菌污染，对罗氏沼虾肝胰腺的整个转录组测序进行了大量研究，根据白斑病感染 (WSSV) 检测肝胰腺和淋巴器官，根据 WSSV 或病毒 PAMP 拷贝 (poly I:C) 检测肠道组织。最近，人们考虑针对 MrNV 病对罗氏沼虾成年虾的造血组织进行转录组学研究。许多不同种类的丰富数据都存在于不同的安全工具中，例如设计确认受体、癌症预防剂和抗菌肽
为了区分与 MrNV 污染相关的差异赏金记录，我们对每个固体 PL 和暂时被 MrNV 污染的 PL 的六次复制进行了 RNA 测序。结果表明，5538 条记录进行了差异通信，其中 2413 条记录是向上控制的，3125 条记录是向下控制的。在这些记录中，其中一部分由于病毒性疾病而与自然安全系统有关。
为了验证我们的记录聚合和差异财富结果，我们还选择了 9 个点进行 qPCR 验证，并在这些质量中表现出较低的虚假披露率。我们筛选了具有重要意义的 DEG 列表，包括设计确认蛋白 (PRP) 和抗病毒蛋白、前酚氧化酶 (ProPO) 框架、Toll-IMD 标记途径、抗菌肽 (AMP) 和凝血框架、吞噬作用和细胞凋亡、癌症预防剂框架和 RNA 阻抗 (RNAi)。各种研究表明 RNAseq 和 qPCR 信息之间存在高度相关性。此外，由于细菌和病毒污染而对罗氏沼虾进行的 RNAseq 研究同样证明了 RNAseq 和 qPCR 结果之间的高度相关性。为了提高我们的确定性，我们在免费的有机示例中批准了这些结果。血液粘稠是一种体液反应，可防止受伤期间血淋巴的恶化和微生物的传播。在清除剂中，血液凝固包括通过血细胞传递的钙辅助转谷氨酰胺酶（TGase）交叉连接全部增稠蛋白（CP）。过去的研究表明，在 TGase 耗尽的虾中，日本国参的溶菌酶和外壳蛋白表达水平下降，这表明血液增稠框架与 AMP 之间存在联系。我们发现转谷氨酰胺酶和半集素-1 样异构体 X2 (HMCN1) 的表达上调。同样，我们批准了 HMCN1 的声明，该声明在 RNAseq 中上调了 5.31 倍，通过 qPCR 上调了 16.07 倍。这些结果表明，这两个凝血部分被包括在内，作为对 MrNV 污染的反应。此外，两个凝血部分、溶菌酶和外壳蛋白的某些亚型的上行指导可能证明了罗氏沼虾中血液增稠框架和AMP之间的联系。