蛋白质组学与生物信息学杂志
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全球蛋白质组学：通过蛋白质组学分析的几何解释进行药效决策

Paul Kearney、Nathan L. Currier、Daniel Chelsky、Clarissa Desjardins、Patrice Hugo、Joanna Hunter、Eustache Paramithiotis、Marc Riviere、Olivier Maes、Howard M. Cherkow 和 Hyman M. Schipper

疾病和药物可以调节血液中数百种蛋白质的浓度，这些蛋白质可以使用现代蛋白质组学方法进行准确测量。然而，出于免疫测定的实用目的，通常的做法是通过几种蛋白质来减少多种疾病和药物效应发展。通过这种还原论方法发现的绝大多数假定生物标志物从未进入临床，原因有两个：检测开发的时间和成本令人望而却步，以及在更广泛的人群中进行验证时还原蛋白组失败的严重风险。全球蛋白质组学是一种替代方法，其中所有受疾病或药物调节的血液蛋白都用于解决药效学问题，而无需开发免疫测定的时间、成本和风险。全球蛋白质组学方法应用于阿尔茨海默病研究，该研究证明大量血浆蛋白可以预测疾病的严重程度（通过简易精神状态检查测量）。此外，该组的一个子集被证明受到疾病治疗（多奈哌齐）的调节，从而提供一种量化治疗反应的方法。最后，为了确定全球蛋白质组学方法具有广泛的实用性，它也被应用于高血压研究，表明还可以得出一组与疾病严重程度（通过血压测量）相关的血浆蛋白。特别是，全球蛋白质组学方法可以轻松区分对高血压治疗有反应和无反应的患者。全局蛋白质组学方法基于生物信息学分析方法，该方法通过蛋白质组相似性对样本进行聚类，然后使用样本相似性的几何表示来回答常见问题 说明还可以衍生出与疾病严重程度（通过血压测量）相关的一组血浆蛋白。特别是，全球蛋白质组学方法可以轻松区分对高血压治疗有反应和无反应的患者。全局蛋白质组学方法基于生物信息学分析方法，该方法通过蛋白质组相似性对样本进行聚类，然后使用样本相似性的几何表示来回答常见问题 说明还可以衍生出与疾病严重程度（通过血压测量）相关的一组血浆蛋白。特别是，全球蛋白质组学方法可以轻松区分对高血压治疗有反应和无反应的患者。全局蛋白质组学方法基于生物信息学分析方法，该方法通过蛋白质组相似性对样本进行聚类，然后使用样本相似性的几何表示来回答常见问题药效学问题。