细胞与发育生物学

细胞与发育生物学
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国际标准期刊号: 2168-9296

抽象的

小鼠胚胎干细胞分化过程中的糖组特征

Rania Harfouche、Somak Ray、Melinda Sanchez、Ushashi Dadwal、Steven R Head、Aaron Goldman 和 Shiladitya Sengupta

背景:糖组已成为细胞命运的关键调节剂,部分原因是它能够增强众多信号通路的作用。我们最近证明,糖组的硫酸化成分通过调节下游生长因子(例如胰岛素样生长因子(IGF)信号轴)在促进胚胎干细胞(ESC)衍生的胚状体的分化中发挥关键作用。然而,由于缺乏快速、简单且易于量化的方法,促进 ESC 分化与干细胞分化的糖组的确切成分仍然未知。作为本研究的概念验证,我们利用定制的糖阵列结合生物信息学和分子生物学工具,以揭示胚状体模型中 ESC 分化的新糖特征。

方法:我们使用定制设计的 Affymetrix 微阵列(Glycogene 芯片)来筛选分化胚状体与未分化 ESC 的转录组。结合基因本体论、通路分析、实时 PCR 和免疫印迹,我们验证了 IGF 家族的参与,此外,还发现了属于糖蛋白(血管生成素-1 和血管生成素样成员)、磺基转移酶、硫酸酯酶和糖基转移酶家族。

结论:这些结果表明,糖基因芯片与拟胚体模型相结合,提供了一种快速可靠的工具来发现新的糖组特征,这些特征对于维持 ESC 干性与分化至关重要。反过来,这将使我们能够了解控制 ESC 命运的机制,使我们离寻找再生医学领域的新范例又近了一步。

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