物理化学与生物物理学杂志
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异质核核糖核蛋白 K 与缺氧诱导因子 1 Alpha 近端启动子的富含胞嘧啶的序列结合，在中性 pH 下形成稳定的 i 基序

Diana J Uribe、Yoon-Joo Shin、Eric Lau、Scot W Ebbinghaus 和 Daekyu Sun

缺氧诱导因子 1 α (HIF-1α) 基因的近端启动子包含聚嘌呤/聚嘧啶 (pPu/pPy) 区域，已证明该区域可影响其 90% 的转录控制。该 pPu/pPy 序列中富含鸟嘌呤的序列已知具有结构动态性，很容易形成具有 1:6:1 折叠模式的 G-四联体结构。在本研究中，我们证明HIF-1α启动子的pPu/pPy束内富含胞嘧啶（富含C）的序列能够形成两种主要的分子内i基序结构，分别为3:3:3或3:4 :2 使用圆二色性、溴足迹和定点突变分析得出接近生理 pH 值的折叠模式。这些结构是第一个已知的 i-基序，在中性 pH 值下形成，过渡 pH 值为 6.9，已发现它们形成于癌基因的近端启动子序列内。此外，电泳迁移率变动分析 (EMSA) 与溴足迹分析相结合表明，异质核核糖核蛋白 K (hnRNP K) 能够以序列特异性方式与富含 C 的序列的未折叠状态结合。综上所述，我们的结果表明，在 HIF-1α 启动子的富含 C 的序列内形成的 i-基序结构可以在生理条件下形成，并且 hnRNP K 可以与该富含 C 的序列结合。