蛋白质组学与生物信息学杂志
开放获取

抽象的

基孔肯雅热潜在新型抑制剂 (37997) 蛋白 nsP2 蛋白酶的同源建模和对接

林蓬波拉

基孔肯雅热是一种病毒性疾病，通过蚊子叮咬传播给人类。基孔肯雅热可引起发烧、发冷、恶心、呕吐、关节痛、头痛和关节肿胀。基孔肯雅热的病因主要是由于基孔肯雅病毒在人体内的复制。nsP2（非结构蛋白 2）蛋白负责基孔肯雅病毒的复制。CHIKV 复制会导致主机一般关闭。一旦RNA复制建立，CHIKV复制就能够抵抗干扰素的抑制，并且CHIKV通过阻止IFN诱导的基因表达来主动抑制抗病毒IFN反应。基孔肯雅病毒的复制和传播依赖于病毒 nsP2 蛋白的蛋白酶活性，将 nsP1234 多蛋白复制复合物切割成功能单元本研究研究了基孔肯雅热 37997 的 nsP2 蛋白酶蛋白，并使用计算方法找到了蛋白酶蛋白中的最佳相互作用位点，并确定了抑制 nsP2 蛋白的最佳配体化合物。同源建模用于预测 nsP2 蛋白酶蛋白的 3 维结构。使用结构验证服务器 (SAVS) 验证 3D 结构，其中 85.2% 的残基存在于 Ramachandran 图的有利区域中。与各种抑制剂进行对接研究，发现LIGAND_4（N-丁基-9-[3,4-二丙氧基-5-（丙氧基甲基）氧杂环戊烷-2-基]嘌呤-6-胺）具有最稳定的相互作用与 nsP2 CHIKV 蛋白酶。