国际标准期刊号: 2155-6148
何塞·曼努埃尔·佩雷斯-阿吉拉尔、杰弗里·G·萨文和刘仁宇
使用 G 蛋白偶联受体 (GPCR) 结构和同源(比较)建模技术构建人类 μ 阿片受体模型。最近发表的基于鼠μ阿片受体的构建体的高分辨率晶体结构提供了一个独特的机会来评估同源模型的可靠性并测试引入更多模板(已知结构)以提高模型准确性的相关性。比较模型。在第一个模型中使用了两个模板:β2肾上腺素受体和牛视紫红质受体。对于第二个模型,使用了四种模板:β 2肾上腺素能、牛视紫红质、β 1肾上腺素能和 A 2A腺苷受体。当使用相同的序列比对时,包含额外的模板可以提高模型的结构基序和其他特征的准确性。预测的结构与重要受体区域尤其相关,例如与受体激活相关的 DRY 基序。此外,本研究表明受体序列相似性在同源建模中至关重要,正如高度多样化的 EC2 环的情况所示。这项研究证明了 μ 阿片受体(GPCR 类视紫红质家族的成员)的同源建模技术的可靠性。添加更多模板提高了模型的准确性。