蛋白质组学与生物信息学杂志
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小鼠脑组织膜蛋白的鉴定和表征

Nguyen Tien Dung、Do Huu Chi、Le Thi Bich Thao、Nguyen Thi Kim Dung、Nguyen Bich Nhi 和 Phan Van Chi

膜蛋白是蛋白质组学研究的有吸引力的目标，因为它们在细胞的许多过程中发挥着重要作用，包括：细胞粘附、免疫反应、代谢和信号转导......研究中，二维凝胶电泳 (2D-PAGE) 通常用于分离复杂的蛋白质组样品。然而，由于膜蛋白的疏水性，该方法在分离膜蛋白时面临困难。在本研究中，使用碳酸盐提取和超速离心制备小鼠脑膜组分。提出了使用基于凝胶的方法结合二维纳米液相色谱在线串联质谱法 (2DNanoLC-Q-TOF-MS/MS) 来分离和鉴定膜蛋白。通过 UniProt 数据库、SOSUI 和 TMHMM 算法验证和预测了总共 298 个来自小鼠脑组织的已鉴定膜蛋白。其中，SOSUI和TMHMM预测了129个（43.3％）具有至少一个跨膜结构域的蛋白质。此外，该函数，