蛋白质组学与生物信息学杂志
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使用计算方法鉴定与 GBM 相关的潜在关键基因

Donthula Niveditha*，M Jahanavi

多形性胶质母细胞瘤（GBM）是一种影响大脑或脊柱的恶性肿瘤，是一种快速生长且具有侵袭性的脑肿瘤。需要确定 GBM 中的新靶点，以提高我们对疾病生物学的理解，并可用于开发新的疗法。因此，我们研究的目的是利用计算方法探索与 GBM 相关的关键基因。在本研究中，我们构建了 GBM 中 159 个基因的相互作用网络。使用拓扑分析方法，即CYTOHUBBA和MCODE，从159个基因中选择13个作为中心基因。利用DAVID对这13个基因进行功能富集分析，发现这些基因在多种功能和通路上富集，其中与凋亡过程、细胞增殖的调节相关性最强。基因本体分析表明，在细胞过程、生物过程和分子功能中分别发现了14、111和17个术语。使用 Kaplan Meier 图对这 13 个基因进行生存分析。这表明 13 个中心基因中有 9 个与 GBM 患者的总生存期相关。VEGFA、TP53、STAT3、EGFR、NOTCH2、MMP9、MYC、HRAS、PTEN可能作为与GBM相关的潜在关键基因用于GBM的诊断、预后和治疗。