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鉴定 DNA 甲基化变异模式以获得潜在的乳腺癌生物标志物基因

徐 L、Mitra-Behura S、Alston B、Zong Z 和 Sun S

人类细胞中 DNA 甲基化模式对于调节肿瘤生长至关重要，并且可以指示乳腺癌易感性。在我们的研究中，我们确定了乳腺癌表观基因组中具有显着甲基化变异的基因，可用作乳腺癌易感性的潜在新型生物标志物。使用统计软件包 R，我们比较了 7 个正常个体与 8 个乳腺癌细胞系的 DNA 甲基化测序数据。这是通过选择正常细胞和癌细胞变异模式落在不同范围内的 CG 位点或胞嘧啶-鸟嘌呤配对，并通过执行上单尾卡方检验来完成的。这些选定的 CG 位点被映射到其相应的基因。使用 ConsensusPath 数据库软件，我们利用数据生成遗传途径，以研究所选基因与致瘤细胞机制之间的生物学关系。利用 PubMeth 和 GeneCards 数据库中的乳腺癌相关基因，我们发现了 26 个潜在的生物标记基因，这些基因与已知与乳腺癌相关的基因存在生物学联系。我们的结果对于乳腺癌易感性的早期筛查和检测措施具有重要意义。此外，随着更多研究探索生物标记基因与刺激肿瘤发生的关联，可能会开发出新的治疗方法。它们与已知与乳腺癌相关的基因有生物学联系。我们的结果对于乳腺癌易感性的早期筛查和检测措施具有重要意义。此外，随着更多研究探索生物标记基因与刺激肿瘤发生的关联，可能会开发出新的治疗方法。它们与已知与乳腺癌相关的基因有生物学联系。我们的结果对于乳腺癌易感性的早期筛查和检测措施具有重要意义。此外，随着更多研究探索生物标记基因与刺激肿瘤发生的关联，可能会开发出新的治疗方法。