免疫组学研究
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抽象的

ImmTree：人类免疫系统中基因和蛋白质进化关系的数据库

Csaba Ortutay、Markku Siermala 和 Mauno Vihinen

背景：免疫系统是一个复杂的机器，基于多种基因和蛋白质的高度协调表达。人类免疫系统的进化史尚不清楚。尽管已经发表了几项与免疫过程的发展和进化相关的研究，但仍然缺乏全面的基于基因组的分析。专注于免疫相关基因进化关系的数据库将有助于并促进免疫学和进化生物学的研究。结果：构建了一个名为 ImmTree http://bioinf.uta.fi/ImmTree 的互联网资源，用于研究人类免疫系统的进化和进化树。ImmTree 包含从 HomoloGene、OrthoMCL 和 EGO 数据库收集的 80 个物种的直系同源信息。除了系统发育树之外，该服务还提供用于比较人鼠直系同源对的数据，包括同义和非同义突变率、Z 值和 Ka/Ks 商。多功能搜索引擎允许从数据库进行复杂的查询。目前，已有 847 个人类免疫系统相关基因和蛋白质的数据。结论：ImmTree 提供了来自人类免疫系统的基因和蛋白质、其系统发育的独特数据集，以及用于比较人-小鼠直系同源对、同义和非同义突变率以及其他统计信息的信息。多功能搜索引擎允许从数据库进行复杂的查询。目前，已有 847 个人类免疫系统相关基因和蛋白质的数据。结论：ImmTree 提供了来自人类免疫系统的基因和蛋白质、其系统发育的独特数据集，以及用于比较人-小鼠直系同源对、同义和非同义突变率以及其他统计信息的信息。多功能搜索引擎允许从数据库进行复杂的查询。目前，已有 847 个人类免疫系统相关基因和蛋白质的数据。结论：ImmTree 提供了来自人类免疫系统的基因和蛋白质、其系统发育的独特数据集，以及用于比较人-小鼠直系同源对、同义和非同义突变率以及其他统计信息的信息。