蛋白质组学与生物信息学杂志
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免疫信息学研究：针对日本脑炎病毒的假定治疗性 T 细胞表位的筛选

拉维·德瓦尔*、维杰·库马尔、阿米特·乔希

日本脑炎是通过蚊子在人类中传播的，并导致大脑周围的膜发炎。在当前的研究中，我们选择了完整的蛋白质组，如CORE PROTEIN C、PREM PROTEIN、MATRIX PROTEIN M、ENVELOPE、NS1、NS2A、NS2B、NS3、NS4B、NS4A、2K、RNA依赖性RNA聚合酶用于T细胞表位鉴定。我们发现了 100 多个具有最高结合亲和力的 MHC II 类新 T 细胞表位。在最终确定的六个表位中，LRPATAWAL 表位（来自非结构蛋白 NS 4 B）和 VRLMEAEGV 表位（来自 RNA 依赖性 RNA 聚合酶）显示出最大的负结合能，即分别为 -8.5 Kcal/mol 和 -8.4 Kcal/mol。结果还通过部署分子动力学和模拟研究进行了验证。这些表位的 RMSD 和 RMSF 值表明与 MHC 等位基因存在完美的相互作用。