免疫组学研究
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非洲马瘟病毒肽疫苗的免疫信息学预测

Malaz Abdelbagi、Tarteel Hassan、Mohammed Shihabeldin、Sanaa Bashir、Elkhaleel Ahmed、Elmoez Mohamed、Shawgi Hafiz、Abdah Abdelmonim、Tassneem Hamid、Shimaa Awad、Ahmed Hamdi、Khoubieb Ali 和 Mohammed A. Hassan

背景：非洲马瘟疫（AHS）是马科动物的一种病毒。它由食血库蠓（双翅目、角蠓科）传播，引起马严重疾病，甚至导致死亡。非洲马病病毒（AHSV） ）是一种双链RNA（dsRNA）病毒，具有10个基因组片段，编码7种结构蛋白（VP1-VP7）和4种非结构蛋白（NS1、NS2、NS3、NS3A）。本研究的目的是分析国家生物技术信息中心（NCBI）数据库中报告的非洲马病病毒（AHSV）毒株（VP2）蛋白，选择可用于设计肽疫苗的所有可能的表位。

材料与方法：从美国国家生物技术信息中心数据库（NCBI）（https://www.ncbi.nlm.nih.gov）检索非洲马病病毒（AHSV）共27个外衣壳蛋白（VP2）序列/蛋白/?term=VP2+African+horse+sickness+virus)于2016年9月7日。利用免疫表位分析数据库(IEDB)对他们进行了多次测试，检测B和T细胞高度保护的免疫原性表位总计选择可用于治疗性疫苗肽的所有可能的表位。

结果和讨论：关于引发抗体免疫反应的表位，“FSPEYY、DKVVEDPESY 和 YDTDQNVV”被提议刺激 B 细胞。虽然每个 MHC I 和 II 的 5 个表位被认为是潜在有前景的表位，它们结合的等位基因数量最多，但所有这些表位都发现对马MHC I类分子(ELA-A3)具有高结合亲和力和最低的结合能力。）结构水平上的单倍型。表位“ YAYCLILAL和 YTFGNKFLL”被代表，因为它们与最大数量的等位基因结合。尽管与 4 个等位基因结合，表位 WFFDYYATL 仍然被代表，因为具有最低的全局能量。据我们所知，目前还没有依据计算机模拟方法的非洲马病病毒（AHSV）疫苗。