蛋白质组学与生物信息学杂志
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变形链球菌新蛋白结构域的计算机发现

Anand Ramesh Varsale、Amol Shriram Wadnerkar、Rajendra Haribhau Mandage 和 Priyanka Khasherao Jadhavrao

变形链球菌是全世界龋齿的主要病原体，并且被认为是所有口腔链球菌中致龋性最强的。我们试图通过使用 HMM 和 BLAST 的两种自动化方法对新蛋白质结构域进行鉴定和功能预测来扩展我们在分子水平上对这种生物体的理解，以开发一套完整的结构域，然后对这些结构域进行手动分析。最终确定了 19 个新的领域和家族。这增强了我们对变形链球菌和一般细菌分子机制（包括蛋白质合成）的理解达到催化作用。此外，我们证明，使用这种类型的计算机方法可以从以前不相关的数据中相当快速地生成新的生物信息，以提高实验室的发现率。