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Insilco 对芒果基因组品种的研究和分析工具的开发

拉比亚·费赞

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芒果是全球广受赞誉的第五大亚热带/热带有机产品作物之一，其种植集中在印度和东南亚。最近，人们对芒果基因组学产生了总体兴趣，以提供用于标记辅助选择和属性关联的设备。没有特别针对芒果的电子研究基因组资产。随后，需要完整的芒果基因组资产来开发检查和芒果种质的管理。在这项研究中，我们对四个芒果品种进行了近转录组研究，例如 cv. 兰格拉，CV。齐尔，简历。雪莉和简历。肯特分别来自巴基斯坦、中国、以色列和墨西哥。

粗数据是通过De-novo排列组合获得的，该排列组合从芒果品种的RNA-Seq数据集中产生了30,953-85,036个unigenes。该项目旨在为主流研究人员和总体人群提供芒果基因组资产，并允许客户根据我们检查的四个品种（cv. Langra、cv. Zill、cv. Shelly 和 cv. Kent）的芒果基因组数据集查看他们的信息。）。芒果网络基因组数据MGdb依赖于三层工程，使用Python、层记录数据库和JavaScript创建。它包含整个基因组的预期质量数据、不同物种中同源质量解释的unigenes以及GO（基因本体论）术语，这些术语简要介绍了它们所包含的特征。该网络基因组资产在评估探索、改进处方、获得遗传特性方面具有巨大的用途，并为核苷酸序列信息的检查提供有价值的生物信息学答案。我们在此报告世界上第一个基于网络的基因组资产，特别是用于遗传改良的芒果基因组资产和芒果基因组委员会。