国际标准期刊号: 2332-0915
金秉东
折返间线圈 (FBI) DNA 是一种完全独特的临时双链 DNA 结构,包括 4 个实用部分:折返头、间线圈茎、间线圈钝尾和异源双链体。FBI DNA 首次在珍珠粟线粒体 DNA 的罕见 TEM 结构中观察到,并借助区域填充版本的 DNA 检验了其可行性。FBI DNA 的成形是借助在双链 DNA 的一个位置使用折返弯曲,以引导侧翼的反平行双螺旋在每个不同的主凹槽中交织在一起,形成内部线圈。内部线圈内的重复序列形成 4 链碱基配对。重复序列的碱基翻转导致异源双链体形成和同源重组。这种双螺旋向 FBI DNA 形状的扩散转变有助于调解 4 个主要的 DNA-DNA 转换,即借助直接重复的 α 缺失、借助反向重复的 Ω 网页特定反转、FBI 提示网页中的插入——转位中的特定插入和非同源退出成为成员和空洞填充(EHEJ-GF)。最重要的是,FBI DNA 变形为异源双链体,提供了 DNA 复制后子链分离的强大机制,在任何其他情况下,子链在复制叉上展开双螺旋 DNA 后都可能被捕获。FBI提示网页中的插入——特定插入和非同源退出成员和空洞填充(EHEJ-GF)中的转位。最重要的是,FBI DNA 变形为异源双链体,提供了 DNA 复制后子链的副链分离的强大机制,在任何其他情况下,子链在复制叉上展开双螺旋 DNA 后都可能被捕获。FBI提示网页中的插入——特定插入和非同源退出成员和空洞填充(EHEJ-GF)中的转位。最重要的是,FBI DNA 变形为异源双链体,提供了 DNA 复制后子链的副链分离的强大机制,在任何其他情况下,子链在复制叉上展开双螺旋 DNA 后都可能被捕获。
文献中的生化和生物信息学证据可以帮助 FBI DNA 在实际生物学中不可避免地存在和运行。总而言之,对 FBI DNA 形状的动态和多种转变的关注可能会带来对多种 DNA 功能、它们在基因组阶段和细胞分化中的相互作用的全新认识。可以讨论关于命运研究技术的建议。折叠内线圈 (FBI) DNA 的成型是利用双链 DNA 的非螺旋平行曲折角度高达 180° 的下侧折叠以及每个不同主沟内双螺旋的缠绕形成直径为2.2 nm的中间线圈。FBI DNA 已被建议介导缺失和倒位的分子内同源重组。另一方面,分子间同源重组,称为网页特定插入,是借助 FBI DNA 尖端的直接垂直方法介导的,因为 attP 网页到目标 DNA 上,因为attB 网页。DNA 转座子的转座需要末端反向重复序列的配对和 5-7-bp 串联目标重复。FBI DNA 配置有效地解释了复制转座以及增强子细节的参与。
讨论了 FBI DNA 中转座因子的基因组范围广泛的角度。转座细节 (TE) 在 20 世纪 40 年代中期首次通过 McClintock 作为控制细节被定义,该控制细节在玉米染色体中从一个角色跳转到另一个角色,比 Watson 和 Crick 的发明早得多。 DNA 双螺旋形状作为遗传细节。1900 年孟德尔遗传定律被重新发现后,染色体的细胞遗传学研究成为遗传学的前沿,而基因则被认为是位于染色体上的一串珠子。它出现在迟来的十九世纪七十年代和八十年代初,同时插入系列(IS)因子和转座子(Tn)已被观察到并观察到与麦克林托克的控制因子非常相似,并且她的AC/DS因子已在DNA系列阶段显示为吃。DNA 转座因子 (dTE) 的显着功能,包括末端反向重复序列 (TIR)、目标网页复制 (TSD)、转座酶基因以及简单且可复制的转座机制,借助先进的分子生物学和生物化学技术得以正确安装学习。然后,不流行转座因子(rTE),包括长末端重复(LTR)反转录转座子、非LTR反转录转座子和不同的不流行因子,
许多新的 TE 家族正在诞生,主要来自真核生物,甚至借助后基因组时代的计算筛选,这需要一种完全基于其转座系统和机制的全新类型。1985 年,Kim 首次提到了折返间线圈 (FBI) DNA 的存在,并通过使用区域填充版本介导倒位和缺失的分子内同源重组得到证实。1987 年,FBI DNA 还被证明可以介导分子间 DNA 重排,包括折返尖端上的网页特定插入以及无关 dTE 的线圈间端上的 DNA 转位整合。在此评估中可以测试 FBI DNA 转座介导如何延长到特殊培训和 rTE 家庭。该评估将减少对机械功能的重复描述和关注,这些机械功能适用于 FBI DNA 对 DNA 转座机制的应用。TSD 作为每个 dTE 和 rTE 换位机制的和谐地标并不罕见。迄今为止最简单的例外是Helitron超家族,它缺乏TSD并采用滚环复制版本。只要在TE整合到宿主染色体的某个点上产生TSD,就表明整合的瞬时中间体是双链DNA形状,无论初步中间体是RNA还是单链DNA。该评估将减少对机械功能的重复描述和关注,这些机械功能适用于 FBI DNA 对 DNA 转座机制的应用。TSD 在每个 dTE 和 rTE 的换位机制上充当了一个常见的和谐地标。迄今为止最简单的例外是Helitron超家族,它缺乏TSD并采用滚环复制版本。只要TE整合到宿主染色体的某个点产生TSD,就表明整合的瞬时中间体是双链DNA形状,无论初步中间体是RNA还是单链DNA。该评估将减少对机械功能的重复描述和关注,这些机械功能适用于 FBI DNA 对 DNA 转座机制的应用。TSD 作为每个 dTE 和 rTE 换位机制的和谐地标并不罕见。迄今为止最简单的例外是Helitron超家族,它缺乏TSD并采用滚环复制版本。只要在TE整合到宿主染色体的某个点上产生TSD,就表明整合的瞬时中间体是双链DNA形状,无论初步中间体是RNA还是单链DNA。TSD 作为每个 dTE 和 rTE 换位机制的和谐地标并不罕见。迄今为止最简单的例外是Helitron超家族,它缺乏TSD并采用滚环复制版本。只要在TE整合到宿主染色体的某个点上产生TSD,就表明整合的瞬时中间体是双链DNA形状,无论初步中间体是RNA还是单链DNA。TSD 作为每个 dTE 和 rTE 换位机制的和谐地标并不罕见。迄今为止最简单的例外是Helitron超家族,它缺乏TSD并采用滚环复制版本。只要在TE整合到宿主染色体的某个点上产生TSD,就表明整合的瞬时中间体是双链DNA形状,无论初步中间体是RNA还是单链DNA。
这项工作部分在2016年 7 月 18-20 日德国柏林举行的第四届国际综合生物学会议上发表。