生物医学数据挖掘国际期刊

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国际标准期刊号: 2090-4924

抽象的

蛋白质组学和生物信息学的交叉点破译蛋白质的新功能

马利尼·拉洛拉亚

蛋白质有时只能在没有其他人参与的情况下发挥作用;它们经常与不同的生物分子结合以实现其能力。这种生物分子通讯网络永远确立了原因,而蛋白质之间发生的通讯承担了特别重要的工作。我们最近已经破解了激素活动期间蛋白质连接的陷阱以及此类通信的结果。我将讨论激素受体与界面蛋白的合作以及与这种联系有关的基本成分。我还将展示这些关联如何导致激素驱动的症状恶化。对受体蛋白关系的深刻理解以及打破合作共犯的联系可能是制定更好的治疗方法来监控与之相关的事件的当务之急。进一步采用这种策略,我将研究相互作用组检查如何区分新的同谋,特别是根据细胞中的空间划分。我将概括介绍旧式胞质蛋白是如何被认为是原子相互作用组的一部分的。我将阐明如何利用联合生物信息学和蛋白质组学方法来预测它们的原子能力。此外,生物信息学和位点协调诱变的综合方法证实了这些通信的前提。最后,我将描述如何利用体内分析来证明这些合作及其有用的本质。我将概括介绍旧式胞质蛋白是如何被认为是原子相互作用组的一部分的。我将阐明如何利用联合生物信息学和蛋白质组学方法来预测它们的原子能力。此外,生物信息学和位点协调诱变的综合方法证实了这些通信的前提。最后,我将描述如何利用体内分析来证明这些合作及其有用的本质。我将概括介绍旧式胞质蛋白是如何被认为是原子相互作用组的一部分的。我将阐明如何利用联合生物信息学和蛋白质组学方法来预测它们的原子能力。此外,生物信息学和位点协调诱变的综合方法证实了这些通信的前提。最后,我将描述如何利用体内分析来证明这些合作及其有用的本质。

过去几十年,利用高通量进步来考虑原子科学框架已经改变了自然和生物医学探索,使分析人员能够仔细检查生命形式的基因组(基因组学)、RNA 颗粒的排列(转录组学)和蛋白质的排列包括它们的结构和能力(蛋白质组学)。由于蛋白质涉及质量和记录之间的分子中心以及许多更高水平的原子和细胞结构和关联,并且通常生理和强迫过程在蛋白质水平上显示,自然和生物医学研究人员逐渐热衷于应用高通量蛋白质组学实现对基础亚原子科学和感染形式的更好理解的策略。

丰富的蛋白质组学信息使分析人员能够提出复杂的有机探究并添加新的逻辑经验。为了促进信息驱动理论时代和自然信息公开,建立了众多与蛋白质相关的生物信息学数据库、查询室和信息检验编程工具,对蛋白质进行整理和有机解释,以帮助整理、辅助、实用和发展研究。路径、系统和框架科学。随着基因组科学和下一代测序 (NGS) 创新的不断取得显着进展,揭示了大量生命形式中丰富的基因组数据,新的蛋白质生物信息学数据库也不断出现,许多现有数据库也得到了改进。随着越来越多的基因组被测序,数据库中记录的蛋白质序列最近显着扩大。这给计算研究者构建新的框架来帮助大数据时代的蛋白质科学研究提出了新的困难。

基因本体项目利用三种分类来描述质量项目或蛋白质。亚原子功能是描述单个蛋白质执行的任务的分类,可以广泛地分为十二个子类别;具体来说,细胞形式、消化、DNA复制/调整、记录/解释、细胞内标记、细胞-细胞对应、蛋白质崩溃/损坏、运输、多功能蛋白质、细胞骨架/辅助、抵抗力和刀枪不入以及随机能力。例如,碱性蛋白质对细胞的可靠性和细胞的总体形状负责,它们的功能不同于制造细胞骨架和聚集跨膜颗粒通道,这是细胞渗透压乃至突触数据运动的基础结构。如果没有蛋白质装置(例如记录复合体或记录气泡),不仅DNA原子无法模仿自身;此外,如果没有蛋白质执行遍历事件和染色体分离,细胞复制和配子产生的有丝分裂和减数分裂事件就无法继续。负责我们身体抵抗力的无懈可击的框架依赖于结构认知,依赖于自我与非自我的分离;这必须通过能够连接和识别身体不熟悉的东西的特定细胞来实现。这种确认形式是通过无敌框架细胞外部的蛋白质-蛋白质关联而发生的,其中限制喜好可以决定是否会启动不受影响的反应,此外,未使用的蛋白质连接或识别可能会导致自动安全感染。细胞呼吸、氧气和二氧化碳运输、食物摄入、能量使用、能量储存、温暖或寒冷的生理反应的生化反应,或任何人们可以理解的生命过程,基本上都是由蛋白质或蛋白质复合物完成的。生物体内发生的所有过程都有蛋白质在正常选择的压力下以精确的方式作用于某个地方。

这些只是蛋白质工作的几个例子。一个令人震惊的现实是,它们可以执行的所有任务都取决于一个典型的准则,即可以形成蛋白质的二十种氨基酸。这就是为什么检查蛋白质及其片段、结构、元素和容量如此重要的动机。我们应该看到这些粒子如何重叠,它们如何聚集到建筑物中,它们在我们想要响应地址的情况下如何工作,例如,为什么我们患有恶性肿瘤,为什么我们变老,为什么我们生病,我们如何发现某些疾病的治疗方法,为什么我们可能知道,生命是沿着这些路线前进的,在这个星球上,而不是在其他任何地方,无论如何都是为了这个场合。

根据《牛津英语词典》,结构生物信息学是概念化有关原子的科学,以物理科学的感觉,并应用从算术、软件工程和见解等命令中获得的信息学方法,来理解、构建和研究相关的基础数据。这些粒子的范围很大。有一些用于蛋白质结构保证的计算策略,包括同源性证明、通过串线进行折痕确认以及胃肌起始技术。

蛋白质分组和结构信息测量的巨大增加,以及探索性和计算性生物信息学策略的推动,正在提高我们对蛋白质排列、结构、元素和能力之间联系的认识。因此,这些信息被用来了解蛋白质如何与不同的原子(例如小颗粒或配体)合作,从而成为药物的后起之秀。最后一个领域是一项将增强读者或学生能力的活动应用一些生物信息学工具从部分 DNA 序列或蛋白质促进数开始,并产生其结构和容量的模型。

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