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肯尼亚西部基苏木青蒿素联合治疗给药后 72 小时内选定时间间隔内青蒿素耐药性标志物的调查

Apollo Asenath、Lorna J Chebon、Keneth Mitei、Benjamin Opot、Dennis W Juma、Andrew Nyerere、Ben Andagalu、Hoseah M Akala 和 Matthew L Brown

背景：治疗或随访过程中的显微镜寄生虫检测表明，肯尼亚接受 ACT 治疗的部分儿童并未完全清除恶性疟原虫寄生虫血症。恶性疟原虫氯喹耐药转运蛋白基因 (Pfcrt76)、多药耐药基因 1 (Pfmdr1)、去泛素化酶基因 (Pfcubp-1) 和网格蛋白囊泡相关接头 2、u 亚基编码基因 (Pfap2mu) 和多药耐药蛋白 1 基因 (Pfmrp1) 突变与 ACT 治疗后随后的专利复发有关。由于迄今为止非洲还没有经过验证的 ACT 耐药标记物，因此在治疗过程中监测这些多态性的变化有助于确定它们在 ACT 治疗结果中的作用。方法：118P。使用序列分析仪对 2013 年至 2015 年 ACT 临床疗效研究中的恶性疟原虫样本进行了耐药性多态性频率的基因分型。每个样本至少被筛选三到四个时间点，即：对于一些受试者，治疗开始前第0天，然后开始治疗后第2天和第3天，加上随后在第42天之前通过显微镜检查出现寄生虫血症的那天。使用序列分析仪对12个微卫星位点进行耐药多态性频率、Pfmdr1基因拷贝数和遗传多样性分型的基因分型。通过分析 12 个微卫星位点确定了四个时间点寄生虫种群的遗传多样性。全球抗疟药耐药性网络的寄生虫清除估算器 (PCE) 用于确定寄生虫清除率。结果：新基因 Pfap2mu 和 Pfubp 的 S145C 和 E1528D 多态性最强，患病率分别为 18% 和 19%。 Pfmdr1 86,184 和 1246 在第 0 天和时间点 3 和 4 之间野生型等位基因显着增加。微卫星谱分析表明8 个群体所有基因座的平均等位基因数量范围为 9.250 至 1.000。Poly α 的多态性最强，有 35 个等位基因。平均无偏 HE 为 0.672，而 8 个种群的香农多样性指数范围为 0.182-0.000，所分析的寄生虫均不具有匹配的单倍型。平均寄生虫清除半衰期为 2.63 小时（95% 置信区间 [CI]），中位清除半衰期为 2.24 小时。寄生虫清除半衰期为1.14-5.05小时。结论：野生型 Pfmdr1 86 增加，184 和 1246 以及零天后 Pfap2mu 和 Pfcubp-1 的多态性表明这些基因可能对 ACT 给药有反应，因此需要持续监测。具有多个 Pfmdr1 拷贝的样本并未表明对寄生虫清除率有影响。尽管这些概况和清除率之间没有相关性，但需要进一步评估以确定这些观察结果的潜在公共卫生影响以及这些基因座作为全世界恶性疟原虫种群中青蒿素敏感性标记的效用。