免疫组学研究
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抽象的

人重链 V(D)J 重组模式的大规模分析

约瑟夫·M·沃尔普和托马斯·B·开普勒

背景：抗原受体基因的体细胞组装过程是免疫系统所特有的，并且主要由随机事件驱动。然而，可能存在微妙的偏差，并为它们的组装和选择所涉及的分子机制提供线索。由于遗传数据库的快速增长，近来大规模努力提供有关免疫球蛋白（Ig）基因的遗传特征及其组装机​​制的基线数据已成为可能。结果：我们收集并分析了近 6,500 个生产性人类 Ig 重链基因，并将它们与 325 个非生产性 Ig 基因进行了比较，这些基因最初是在框外重新排列的，因此不会因选择而产生偏差。我们发现了 n 核苷酸束长度分布差异的证据，这对涉及 n 核苷酸聚合的机制有有趣的解释。此外，我们还发现了 D 和 J 细分市场配对偏好的惊人统计证据。我们提出了一个统计模型来支持我们的假设，即这些配对偏差是由于多次连续的 D 到 J 重排造成的。结论：我们在此提出目前可用的基因片段使用频率的最精确估计，以及有关 n 核苷酸分布和 DJ 片段对偏好的分析。此外，我们提供了第一个统计证据，表明 B 细胞个体发育过程中人类重链位点发生连续 DJ 重组，频率约为 20%。