蛋白质组学与生物信息学杂志
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抽象的

戈登链球菌整个分泌组和淀粉酶沉淀的分泌组蛋白的质谱分析

Maddi A、Haase EM 和 Scannapieco FA

口腔生物膜（牙菌斑）是由“先锋物种”最初粘附在唾液蛋白上形成的，唾液蛋白在牙齿表面形成牙膜。戈登链球菌就是这样的先锋物种之一，已知其通过特定的淀粉酶结合蛋白（例如淀粉酶结合蛋白 A (AbpA)）来结合唾液淀粉酶。最近的研究表明，一旦结合，唾液淀粉酶似乎可以调节戈登沙门氏菌的基因表达。然而，尚不清楚这种淀粉酶诱导的基因表达是否会导致在斑块生物膜形成中发挥作用的蛋白质的分泌。在这项研究中，我们检查了 S. gordonii KS1（野生型）和 AbpA 缺陷型 (ΔAbpA) 菌株之间分泌蛋白质组的差异。我们还检查了与唾液淀粉酶孵育后差异沉淀的分泌蛋白。通过 nano-LC/MS/MS 分析 KS1 和 ΔAbpA 的培养上清液，以表征 KS1 和 ΔAbpA 的整个分泌蛋白质组。在 KS1 和 ΔAbpA 分泌组中总共鉴定了 107 个蛋白质，其中 72 个蛋白质预计具有 N 端分泌信号肽。KS1 和 ΔAbpA 分泌组之间有 5 种蛋白质差异表达；AbpA 和分选酶 B ​​仅由 KS1 表达，而 Gdh、AdcA 和 GroEL 仅由 ΔAbpA 表达。将 KS1 和 ΔAbpA 的培养上清液与淀粉酶 (50 μg/ml) 在室温下孵育 2 小时，导致分泌蛋白的差异沉淀。假设蛋白 (SGO_0483)、阳离子转运 ATP 酶 YfgQ (Aha1)、异柠檬酸脱氢酶 (Icd)、分选酶 A (SrtA)、β-N-乙酰己糖胺酶 (SGO_0405)、肽链释放因子 1 (PrfA) 和心磷脂合酶 (SGO_2037) 通过淀粉酶从 KS1 培养物上清液中沉淀。在已鉴定的分泌蛋白和淀粉酶沉淀蛋白中，转录调节因子 LytR (SGO_0535) 和阳离子转运 ATPase YfgQ (Aha1) 是潜在的信号蛋白。