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使用基于文献的基因优先排序工具 Genie 对乳腺癌分子谱进行宏基因组分析：一种新方法

阿米特·库马尔·亚达夫和维迪亚·贾哈

背景：乳腺癌的生物学复杂性和异质性可以通过分子谱来解释。微阵列技术是研究它的首选方法。但也有一定的局限性。计算技术是研究基因表达谱的一种新方法。

材料和方法： Genie，一种免费的基于网络的软件，用于分析来自 MEDLINE、NCBI Gene 和 HomoloGene 数据库的文献、基因和同源性信息。给出的输入是目标物种（智人）和生物医学主题（乳腺癌）。根据输入提供的目标物种基因进行优先排序。

结果： 1906 个报告基因的排名与预期不符。因此，他们根据点击次数手动重新排名。这些被缩小到70个。这些基因编码的蛋白质及其功能从NCBI数据库中获得。根据它们在致癌过程中的功能和作用，这些基因被分为不同的类别。

结论：已经证明了一种研究乳腺癌分子谱的新计算方法。建议使用 70 个基因组成的组来研究乳腺癌的基因表达谱。这些基因全面评估乳腺癌分子发病机制的各个方面，并推荐用于未来的临床研究。