免疫组学研究
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模拟寻常型天疱疮相关肽与 MHC II 类 DR 和 DQ 等位基因的结合构象

Joo Chuan Tong、Jeff Bramson、Darja Kanduc、Selwyn Chow、Animesh A Sinha 和 Shoba Ranganathan

背景：寻常型天疱疮 (PV) 是一种严重的自身免疫性水疱性疾病，其特征是存在针对桥粒芯糖蛋白 3 (Dsg3) 的致病性自身抗体，涉及白种人中的特定 DR4 和 DR6 等位基因以及亚洲人中的 DQ5 等位基因。由于缺乏作为训练数据的 PV 相关等位基因特异性肽，用于识别潜在 Dsg3 表位的基于序列的预测算法的开发取得了有限的成功。结果：在这项工作中，我们构建了 10 个 PV 相关、非相关和保护性等位基因的原子模型。之前鉴定的九种刺激性 Dsg3 肽：Dsg3 96–112、Dsg3 191–205、Dsg3 206–220、Dsg3 252–266、Dsg3 342–356、Dsg3 380–394、Dsg3 763–777、Dsg3 810–824 和 Dsg3 963– 977、对接到每个模型的结合槽中以分析等位基因特异性结合的结构方面。结论：我们的对接模拟与 DR4 和 DR6 PV 患者的体外竞争性结合测定和 T 细胞增殖研究获得的功能数据完全一致。我们的研究结果证实，DRB1*0402 在 DR4 PV 中特定自肽的选择中发挥着至关重要的作用。DRB1*0402 和 DQB1*0503 不一定共享相同的核心残基，表明两个等位基因可能具有不同的结合特异性。此外，我们的结果证实了以下假设：等位基因 DQB1*0201 和 *0202 通过以比易感等位基因更大的亲和力结合 Dsg3 肽来发挥保护作用，从而有效删除自身反应性 T 细胞。我们的对接模拟与 DR4 和 DR6 PV 患者的体外竞争性结合测定和 T 细胞增殖研究获得的功能数据完全一致。我们的研究结果证实，DRB1*0402 在 DR4 PV 中特定自肽的选择中发挥着至关重要的作用。DRB1*0402 和 DQB1*0503 不一定共享相同的核心残基，表明两个等位基因可能具有不同的结合特异性。此外，我们的结果证实了以下假设：等位基因 DQB1*0201 和 *0202 通过以比易感等位基因更大的亲和力结合 Dsg3 肽来发挥保护作用，从而有效删除自身反应性 T 细胞。我们的对接模拟与 DR4 和 DR6 PV 患者的体外竞争性结合测定和 T 细胞增殖研究获得的功能数据完全一致。我们的研究结果证实，DRB1*0402 在 DR4 PV 中特定自肽的选择中发挥着至关重要的作用。DRB1*0402 和 DQB1*0503 不一定共享相同的核心残基，表明两个等位基因可能具有不同的结合特异性。此外，我们的结果证实了以下假设：等位基因 DQB1*0201 和 *0202 通过以比易感等位基因更大的亲和力结合 Dsg3 肽来发挥保护作用，从而有效删除自身反应性 T 细胞。我们的研究结果证实，DRB1*0402 在 DR4 PV 中特定自肽的选择中发挥着至关重要的作用。DRB1*0402 和 DQB1*0503 不一定共享相同的核心残基，表明两个等位基因可能具有不同的结合特异性。此外，我们的结果证实了以下假设：等位基因 DQB1*0201 和 *0202 通过以比易感等位基因更大的亲和力结合 Dsg3 肽来发挥保护作用，从而有效删除自身反应性 T 细胞。我们的研究结果证实，DRB1*0402 在 DR4 PV 中特定自肽的选择中发挥着至关重要的作用。DRB1*0402 和 DQB1*0503 不一定共享相同的核心残基，表明两个等位基因可能具有不同的结合特异性。此外，我们的结果证实了以下假设：等位基因 DQB1*0201 和 *0202 通过以比易感等位基因更大的亲和力结合 Dsg3 肽来发挥保护作用，从而有效删除自身反应性 T 细胞。