蛋白质组学与生物信息学杂志
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抽象的

植物中 BZIP 蛋白的分子表征和系统发育分析

Dhivya Selvaraj、Arul Loganathan 和 Sathishkumar Ramalingam

BZIP是一类二聚体序列特异性DNA结合蛋白，其结构为二分式，含有与亮氨酸拉链相邻的富含碱性氨基酸的区域。其特征是几个亮氨酸残基按七个氨基酸间隔规则排列，碱性区域直接与DNA接触。亮氨酸拉链通过真核生物特有的平行相互作用介导蛋白质单体的异二聚化和同二聚化。植物拟南芥基因组显示 67 个 BZIP 蛋白。我们预测了植物中 α 螺旋亮氨酸拉链的二聚体特性和 BZIP 蛋白的卷曲螺旋结构。在该分析中，重点关注亮氨酸拉链的长度、疏水界面中天冬酰胺的位置以及螺旋间静电相互作用的存在。通过研究植物中存在的BZIB的进化关系，还构建了系统发育树。